开源项目 `surface-distance` 教程

开源项目 surface-distance 教程

surface-distanceLibrary to compute surface distance based performance metrics for segmentation tasks.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/su/surface-distance

1. 项目目录结构及介绍

surface-distance 是一个由 Google DeepMind 创建的库,用于计算图像分割任务中基于表面距离的性能指标。以下是项目的基本目录结构及其功能:

.
├── surface_distances             // 核心代码,包含各种表面距离计算函数
│   └── metrics.py                 // 包含计算平均表面距离、Hausdorff 距离等的函数
├── README.md                      // 项目说明文档
├── CONTRIBUTING.md                // 贡献指南
├── LICENSE                        // 许可证文件(Apache 2.0)
└── surface_distance_test.py       // 测试文件,包含了简单使用的示例

surface_distances 目录是主要的代码存放位置,其中 metrics.py 文件实现了各种表面距离计算方法。README.md 文件提供项目概述、安装指南以及简单的使用说明。

2. 项目启动文件介绍

该库没有特定的启动文件,因为它主要用于导入到其他Python项目中使用。你可以在 surface_distance_test.py 文件中找到一些基本的使用示例。例如,要测试库的功能,可以按照以下方式运行测试脚本:

python surface_distance_test.py

这将执行库中的不同测试案例,验证其计算性能指标的正确性。

3. 项目的配置文件介绍

surface-distance 项目本身不包含任何特定的配置文件。配置通常是通过在调用库函数时传入相关参数来完成的。比如,当你计算表面DICE系数时,可能需要指定一个距离容忍值 (tolerance_mm)。例如:

from surface_distances.metrics import compute_surface_dice_at_tolerance

# 假设已有的表面距离数据
surface_distances = ...
tolerance_mm = 0.5

dice_coeff = compute_surface_dice_at_tolerance(surface_distances, tolerance_mm)

在这个例子中,compute_surface_dice_at_tolerance 函数接受从 compute_surface_distances() 得来的表面距离数据和一个距离容忍值作为输入。

请注意,如果你打算集成这个库到自己的项目中,可能会需要创建自定义配置文件以存储你的特定设置,但这不在 surface-distance 库本身的范围之内。

为了完整地使用和集成此库到你的项目,建议仔细阅读 README.md 文件,了解详细的安装步骤和如何调用提供的函数。

surface-distanceLibrary to compute surface distance based performance metrics for segmentation tasks.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/su/surface-distance

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