Multi-BioNER 项目使用教程

Multi-BioNER 项目使用教程

Multi-BioNERCross-type Biomedical Named Entity Recognition with Deep Multi-task Learning (Bioinformatics'19)项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mu/Multi-BioNER

1. 项目目录结构及介绍

Multi-BioNER/
├── model/
│   └── (模型相关文件)
├── data_bioner_5/
│   └── (数据集文件)
├── .gitignore
├── LICENSE
├── README.md
├── requirements.txt
├── run_lm-lstm-crf5.sh
├── seq_wc.py
├── train_wc.py

目录结构说明

• model/: 存放模型相关文件的目录。
• data_bioner_5/: 存放数据集文件的目录。
• .gitignore: Git 忽略文件配置。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• README.md: 项目说明文档。
• requirements.txt: 项目依赖库配置文件。
• run_lm-lstm-crf5.sh: 项目启动脚本。
• seq_wc.py: 序列处理相关脚本。
• train_wc.py: 训练相关脚本。

2. 项目启动文件介绍

run_lm-lstm-crf5.sh

该文件是项目的启动脚本，用于运行模型。使用方法如下：

./run_lm-lstm-crf5.sh

启动步骤

1. 下载数据集: 首先需要下载数据集并解压到 data_bioner_5/ 目录下。
2. 运行脚本: 执行 run_lm-lstm-crf5.sh 脚本以启动模型。

3. 项目的配置文件介绍

requirements.txt

该文件列出了项目运行所需的 Python 依赖库。使用以下命令安装依赖：

pip install -r requirements.txt

依赖库说明

• torch: PyTorch 深度学习框架。
• transformers: Hugging Face 提供的预训练模型库。
• numpy: 数值计算库。
• pandas: 数据处理库。

LICENSE

项目采用 Apache-2.0 许可证，详细内容请查看 LICENSE 文件。

README.md

项目说明文档，包含项目的基本介绍、使用方法和相关链接。

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以上是 Multi-BioNER 项目的基本使用教程，希望对你有所帮助。

Multi-BioNERCross-type Biomedical Named Entity Recognition with Deep Multi-task Learning (Bioinformatics'19)项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/mu/Multi-BioNER