CMeKG_tools 安装与配置完全指南
CMeKG_tools 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cm/CMeKG_tools
项目基础介绍
CMeKG_tools 是一个强大的开源项目,专注于中文医学知识图谱(Chinese Medical Knowledge Graph, CMeKG)的构建。它利用自然语言处理(NLP)与文本挖掘技术,通过对大规模医学文本数据的分析,采用人机协作模式,提供了三大核心功能组件:医学文本分词、医学实体识别以及医学关系抽取。项目基于Python语言,非常适合医学信息处理、NLP研究人员及开发者。
关键技术和框架
- Python: 作为主编程语言,支持丰富的NLP库。
- BERT: 强大的预训练模型用于关系抽取,属于transformers库的一部分。
- PyTorch: 深度学习框架,用于模型的训练和调优。
- Numpy: 数学运算库,常用于数据预处理。
- Torch: 与PyTorch紧密相关,提供更多的深度学习工具。
- tqdm: 提供进度条,提升用户体验。
- random, json, re: 标准库,用于数据处理和配置管理。
准备工作与安装步骤
第一步:环境准备
-
安装Python: 确保您的计算机已安装Python 3.6或更高版本。
python --version
如未安装或版本不符,请访问Python官方网站下载安装。
-
安装虚拟环境: (推荐)为了项目隔离,建议使用虚拟环境。
pip install virtualenv virtualenv cmekg_env source cmekg_env/bin/activate # 对于Windows,使用命令 `cmekg_env\Scripts\activate`
第二步:克隆项目
-
在本地创建一个工作目录,并通过Git克隆仓库。
git clone https://github.com/king-yyf/CMeKG_tools.git cd CMeKG_tools
第三步:安装依赖
-
使用pip安装项目所需的依赖。
pip install -r requirements.txt
第四步:下载模型
-
注意:项目中的模型并未直接包含在仓库内,你需要手动下载。模型位于百度网盘,链接和密码可在
README.md
文件中找到。分别下载关系抽取(RE)、医学实体识别(NER)和分词(CWS)的模型,并按说明放置在相应目录下。- RE模型: 链接: https://pan.baidu.com/s/1cIse6JO2H78heXu7DNewmg 密码: 4s6k - NER模型: 链接: https://pan.baidu.com/s/16TPSMtHean3u9dJSXF9mTw 密码: shwh - 分词模型: 链接: https://pan.baidu.com/s/1bU3QoaGs2IxI34WBx7ibMQ 密码: yhek
第五步:配置文件
- 根据你的实际路径,可能需要调整模型路径。打开相关的
.py
文件(如medical_re.py
,medical_ner.py
,medical_cws.py
),确保模型文件路径正确指向你下载的模型位置。
第六步:验证安装
-
尝试运行项目中的示例代码来验证一切是否就绪。例如,你可以测试医学关系抽取功能:
python run_example.py
请确保替换或按照实际文件路径调整任何必要的配置项,以便于成功执行示例代码。
至此,您已成功安装并配置了CMeKG_tools项目,现在可以开始探索中文医学知识图谱的构建与应用之旅了。在开发过程中,如果遇到问题,查阅项目文档和GitHub讨论区是寻找解决方案的好方法。
CMeKG_tools 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cm/CMeKG_tools