AutoDock-Vina 项目推荐
AutoDock-Vina AutoDock Vina 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/au/AutoDock-Vina
1. 项目基础介绍和主要编程语言
AutoDock-Vina 是一个开源的分子对接和虚拟筛选程序,由 The Scripps Research Institute 的 Forli Lab 维护和开发。该项目的主要编程语言包括 C++、Python 和 C。AutoDock-Vina 是 AutoDock 套件中的一个重要组件,广泛应用于药物发现和分子模拟领域。
2. 项目核心功能
AutoDock-Vina 的核心功能包括:
- 分子对接:支持蛋白质与小分子之间的对接模拟,用于预测分子间的结合模式和亲和力。
- 虚拟筛选:支持批量处理多个配体,进行大规模的虚拟筛选,以识别潜在的药物候选分子。
- 宏环分子支持:能够处理包含宏环结构的分子,扩展了其应用范围。
- 水合对接协议:支持水合状态下的对接模拟,更接近真实生物环境。
- Python 绑定:提供 Python 3 的绑定,方便在 Linux 和 Mac 系统上进行集成和扩展。
3. 项目最近更新的功能
AutoDock-Vina 最近的更新包括:
- AutoDock Vina 1.2.0:引入了新的对接方法和扩展的力场,提升了对接的准确性和速度。
- Python 绑定:增加了对 Python 3 的支持,使得用户可以更方便地使用 Python 进行脚本编写和自动化操作。
- Bugfix 修复:修复了多个已知的 bug,提升了程序的稳定性和可靠性。
- 文档更新:更新了安装说明、教程和文档,帮助用户更好地理解和使用 AutoDock-Vina。
通过这些更新,AutoDock-Vina 进一步巩固了其在分子对接和虚拟筛选领域的领先地位,为科研和药物发现提供了强大的工具支持。
AutoDock-Vina AutoDock Vina 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/au/AutoDock-Vina