gnuplot 安装问题

在使用fasta-toolkit的过程中fastq_quality_boxplot_graph.sh时需要安装gnuplot这个软件

安装步骤网上都能google到,这里就不介绍了。

简单说下遇到的问题

1.使用时会缺少prologue.ps文件

这个文件应该是一个配置文件,所使用的软件会提供这个配置文件,也可以自己编辑设置。另外这个文件需要加入到gnuplot的loadpath中。可以在gnuplot中输入set loadpath设置路径。

2.使用时会有unknown or ambiguous terminal type type just 'set terminal' for a list这个问题

这个问题是由于libgd的版本低造成的需要在终端中安装libgd2以上的版本

ubuntu中输入sudo apt-get install libgd2-dev安装

安装之后在重新安装gnuplot就可以在set terminal命令下看到更多能够支持的类型包括.png .jpg .gif等等


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要在Linux上安装gnuplot,你可以按照以下步骤进行操作: 1. 首先,你需要下载gnuplot安装文件。你可以使用wget命令来下载。比如,你可以使用以下命令来下载gnuplot的tar.gz文件: ``` wget http://nchc.dl.sourceforge.net/project/gnuplot/gnuplot/4.4.0/gnuplot-4.4.0.tar.gz ``` 这个命令将会下载gnuplot的版本4.4.0的tar.gz文件。你可以根据需要选择不同的版本。 2. 下载完成后,你需要解压缩文件。你可以使用以下命令来解压缩tar.gz文件: ``` tar -zxvf gnuplot-4.4.0.tar.gz ``` 这个命令将会解压缩gnuplot的tar.gz文件。 3. 进入解压后的gnuplot目录。你可以使用以下命令来进入目录: ``` cd gnuplot-4.4.0 ``` 4. 接下来,你需要配置安装选项。你可以使用以下命令进行配置: ``` ./configure --prefix=/home/song/gnuplot ``` 在这个命令中,`--prefix=/home/song/gnuplot`选项指定了gnuplot安装的目标路径为`/home/song/gnuplot`。你可以根据自己的需求更改这个路径。 5. 配置完成后,你需要编译gnuplot。你可以使用以下命令进行编译: ``` make ``` 6. 编译完成后,你可以使用以下命令来安装gnuplot: ``` make install ``` 这个命令将会将gnuplot安装到之前指定的目标路径。 安装完成后,你可以在指定的目标路径中找到gnuplot,并开始使用它进行数据的可视化。你可以参考中提供的链接,了解如何在Ubuntu下使用gnuplot进行数据的可视化。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>

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