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RSS订阅原创 菜鸟自学03：安装Miniconda
菜鸟自学03：安装Miniconda首先了解 conda、Annoconda、Miniconda的关系 昨晚在修改bashrc文件时服务器突然掉线了，导致bashrc文件不正常关闭，结果临时生成了.bashrc.swp文件，再次编辑bashrc文件会提示该文件已存在。 原因：在用vim打开一个文件时，其会产生一个cmd.swap文件，用于保存数据，当文件非正常关闭时，可用此文件来恢复...
2018-08-02 09:48:27
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原创 菜鸟自学02：下载参考基因组及构建bowtie2索引
菜鸟自学02：构建bowtie2索引对于生信小白我而言，摆在我面前的主要有两个问题：bowtie2是干嘛的软件？怎么构建bowtie2索引？ 问题1：bowtie2是干嘛的软件？ bowtie的本义是“领结”，一通搜索可以快速知道，bowtie在生信里是一个短序列比对工具，这样的工具还有fasta、blast、bowtie、shrimp、soap等。bowtie有其他类似工具所不具备的优点...
2018-08-01 19:11:15
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原创 菜鸟自学之——SRA Toolkit 的下载和使用
菜鸟自学之——SRA Toolkit 的下载和使用第一次写博客，必须mark一下：2018.07.27sra toolkit是ncbi上将 .sra文件转换为 .fstaq.gz文件的工具。 1.下载/调用 SRA Toolkit 可以直接在linux里在线下载，要根据自己的系统选择合适的安装版本。我查看了一下主机的linux为redhat类型，没找到这个类型的版本，又去服务器看了...
2018-07-27 21:06:39
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空空如也
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