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原创 PowerShell修改文件夹内所有文件名称/SDMs未来环境因子重命名简易操作

目录下的文件进行重命名,确保不会将包含连字符(-)的文件名部分包含在内。这个脚本会检查文件名的倒数第五个字符,如果不是连字符,则保留最后五个字符,否则只保留最后四个字符。# 如果不是'-',保留最后5个字符。# 如果是'-',只保留最后4个字符。# 检查文件名的倒数第五个字符是否为'-'Write-Host "文件重命名完成。# 获取不包括扩展名的文件名。# 获取文件的扩展名。# 设置要处理的文件夹路径。# 获取文件夹中的所有文件。# 切换到目标文件夹。# 遍历文件并重命名。

2024-07-11 23:48:40 283

原创 biomod2代码探讨

这一块中有两个完全一样的MAXENT,这两个分别代表什么意思呢。其余代码都能吸收掌握,唯独这一块不行。

2024-07-07 15:48:15 114

原创 Maxent等物种分布模型的质心迁移

5点集转线,可以在不同的点中间添加线,更直观的表达迁移方向和距离(数据管理工具-要素-点集转线)4合并,将不同时期或不同气候浓度的点进行合并,将其放置于一个矢量数据中(地理处理-合并)2栅格转面,将高适生区由栅格数据转为矢量的面数据,(转换工具-栅格转出-转面)3平均中心,计算得到矢量数据的中心点(空间统计工具-度量地理分布-平均中心)1 右键选择所需图层,一般进行的是高适生区的迁移分析,即右键选择高适生区。在gis中打开栅格文件。

2024-05-27 16:28:43 165

原创 biomod2环境因子预处理-筛选建模环境因子

由于环境指标之间可能存在较强相关性,数据冗余不仅会降低运算效率,还会影响到适生区识别结果的稳定性,因此由此要对生境特征变量进行筛选。另一方面,使用MaxEnt模型对所有环境因子进行预处理,得到不同环境因子对物种地理分布的因子贡献率。一方面,对所有环境因子进行Pearson相关性分析,判断不同环境因子间是否具有相关性。以因子贡献率为基础,结合相关性分析结果,选择用于建模的环境因子。

2024-05-02 21:35:35 150 1

原创 biomod2伪随机点的选取

由于 Biomod2(biodiversity modelling2)使用的物种出现数据的类型是存在-缺失模型(presence-absence)(即输入数据是物种出现和缺失的观测坐标)(Thuiller etal,2009)。除了存在点数据,还需要缺失数据(缺失是指在实地取样时物种没有出现,即伪存在数据(pseudo-absence)(Barbet-Massin etal.,2012)。如果实际存在记录的数量大于1000,我们随机选择与存在记录点数量一样的伪存在数据点。

2024-05-02 18:17:08 378 1

原创 biomod2包括的物种分布模型

模型名称 缩写 广义线性模型 Generalized linear model GLM 推进式回归树模型 Generalized boosting model GBM 广义相加模型 Generalized additive model GAM 多元适应回归样条函数Multivariate adaptive regression splines model MARS 分类树分析模型 Classification tree analysis model C

2024-05-02 18:04:07 61 1

原创 MaxEnt最大熵模型质心迁移计算

在GIS中打开工具箱,添加SDMtoolbox工具箱,选择“ SDM Tools”模块中“ MaxEnt Tools"子目录。“Distribution Changes Between BinarySDMs”工具用于依次计算各个时期物种适生区的范围变化,得到物种分布的增加区、稳定区和损失区。“Centroid Changes(Lines)”工具用于计算不同时期预测分布的几何重心位移情况,从而分析物种分布区的总体扩散趋势。使用软件ArcGIS,使用插件:SDMtoolbox工具箱。

2024-05-02 17:54:22 207

原创 HWSD的土壤数据提取

从HWSD 获取的土壤数据经过处理之后,得到的是一个多合一的栅格数据,基于此我们需要提取得到某一想要的单独数据。4.右键查找表可以进行批处理,但目前并未找到合适方法直接提取所有数据,只能通过批处理手动添加。3.输入栅格为土壤栅格,查找字段为所需要的字段,输出栅格选择合适的位置及命名即可。2.工具箱-3D Analyst 工具-栅格重分类-查找表。1.将土壤数据导入gis后,先定义投影为WGS1984。

2024-04-30 14:06:15 249 1

原创 批量查询高等植物的学名、中文名、科、属、种、分布区以及濒危等级等

devtools::install_github("helixcn/LPSC", build_vignettes = TRUE)#LPSC包的安装。#LPSC 批量查询高等植物的学名、中文名、科、属、种、分布区以及濒危等级等。data2 <- show_detail(data$物种)write.csv(data2,"a.csv")#输出。show_iucn_status("矮牡丹")

2024-04-01 19:24:22 436

原创 从GBIF中获取研究区内物种经纬度信息

filter(kingdom == "Plantae") %>% #kingdom填物种类型,动物为Animalia,植物为Plantae。#参考网站:https://blog.sciencenet.cn/blog-3432920-1238640.html。##筛选条件运行后,最下面会出现一个网址:https://doi.org/10.15468/dl.zdqzft。#在网址内下载物种数据。#####读取物种信息。

2024-04-01 19:22:09 397

空空如也

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