biomod2伪随机点的选取

本文讨论了Biomod2软件中使用存在-缺失模型进行物种分布建模的方法,强调了伪存在数据(随机选择)的重要性,以及非存在点数据质量对模型准确性的影响,最后提到数据整理为二元格式的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

由于 Biomod2(biodiversity modelling2)使用的物种出现数据的类型是存在-缺失模型(presence-absence)(即输入数据是物种出现和缺失的观测坐标)(Thuiller etal,2009)。除了存在点数据,还需要缺失数据(缺失是指在实地取样时物种没有出现,即伪存在数据(pseudo-absence)(Barbet-Massin etal.,2012)。伪存在点即在研究区域中不存在该物种的经纬度坐标点。

伪存在数据的最佳来源取决于建模技术,其中首选的是随机选择(random)(Silleroetal.,2021)。根据 Barbet-Massin(2012)的研究,在覆盖物种分布点的研究区域内采用随机选择法生成伪存在数据点。如果存在记录点数量小于1000,我们随机选择相同数量的伪存在数据;如果实际存在记录的数量大于1000,我们随机选择与存在记录点数量一样的伪存在数据点。

BIOMOD2程序包运行时,需要物种的存在点和非存在点两种信息数据,非存在点数据质量,能影响模型识别的准确性。因此将物种分布数据整理为建模所需的二元数据文件(即用1表示存在点、用0表示非存在点),作为建模过程中的因变量。

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