【已解决】通过PMID或PMCID下载sc-Seq基因数据集

PMID和PMCID的区别在于编号的系统不一样,PMID是PubMed为每一篇文献给予的特定编号,而PMCID是PMC为每一篇文献给予的特定编号。有PMID号码的文献一定会有PMCID号码,而有PMCID号码的文献并不一定有PMID号码。

在 PubMed 查询文献的时候,经常会看到PMID和PMCID号码,而有的文献只有PMID号码,而没有PMCID号码。两者之间有何区别和联系?兴趣驱使,研究了一下。

PMID

PMID是NIH(National Institutes of Health ,美国国立卫生研究院)为PubMed搜索引擎中收录的文献的一个编号。PMID的作用类似于书籍的国际标准书号(ISBN),或者人的身份证,每一篇文献对应的一个PMID号码,通过PMID号码我们就可以找到唯一对应的文献。

PubMed 收录了多少文献,就有多少PMID号码。因此PMID号码会一直增加下去。

我们可以在 PubMed 查询一下,PMID号码为1的是一篇1975年发表于Biochem Med的文献:Formate assay in body fluids: application in methanol poisoning。作者是Makar AB。

那是不是 PubMed 收录的最早的文献就是1975年的?事实并不是如此,在PubMed上可以查到1950年的文献,比如这篇:AYRES JC , FEEMSTER RF. Serologic tests in the diagnosis of infectious diseases. N Engl J Med. 1950 Dec 28;243(26):1034-43. 但是它所对应的PMID号码是:14785777。

具体怎么编码的我想应该是从1975年文献就开始电子化了,或者1975年PubMed成立,就从当年的文献开始编号PMID。而之前的文献是经过电子化后又后来编入的,因此PMID号码就大。另外一个原因可能是MEDLINE只收录了1975年以后文章,PubMe根据随MEDLINE的文献进行编号。而1975年以前的文献是逐步加入的。但是具体原因我不清楚,只是猜测而已。

迄今为止,PMID号码已达8位数,打头数字是2。

如果知道PMID号码,可以直接在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed中直接输入PMID号码就可以查询,或者是PMID号码[UID]的形式查询。

PMID在 EndNote 中有大用处,可以方便的找到文献。这个将来再说。

PMCID

PMCID(PubMed Central reference number)是PubMed中心为文献归档号码。PubMed中心简称PMC,是收录免费文献的地方。在PMC查询到的文献都是Open Access,即免费获取。因此,如果一篇文献提交给PMC都要提供电子全文。PMC为这些文献进行编号,即PMCID。

同样,在PMC (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc)可以直接利用PMCID查询到特定的文献。

不过,在PMC查不到PMCID为1的文献,甚至100也没有,多了我没试。

PMID和PMCID的区别

因此我们看出,PMID和PMCID的区别在于编号的系统不一样,PMID是 PubMed 给予文献的编号,而PMCID是PMC给予文献的一个编号。两者都是文献的身份证。

正如一个人可以同时持有中国身份证和美国绿卡一样。

但是有PMID号码的文献并不一定有PMCID号码,一般只有免费全文Open Access的文献才有PMCID。相反,我个人认为,有PMCID号码的一定会有PMID号码。

PMID和PMCID之间的转换和查询可以通过这个:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/pmctopmid/

参考文章:http://www.howsci.com/pmid-pmcid.html

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