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原创 已提交NCBI的叶绿体基因组序列应该如何更新
第二次重新发送了fasta格式序列,回复邮件说新提交序列与原序列相同,无法修改(确实是同一条序列,但是重新注释后基因数量和类型不一样了,而在fasta格式下没有注释信息,可能二者没有差距?)这种情况应该怎么把原序列更新为新注释后的序列呢?请问一下,已经上传过的序列应该如何修改呢?(已经提交并且有序列号,但是重新注释修改过,应该如何把已存在的序列更改为新注释的序列呢?尝试过发送邮件,第一次发送了gb格式的新序列,但是回复邮件说需要提交fasta格式。
2023-06-28 00:17:15
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原创 用fastq-dump --split-3 *将SSR文件转换为fastq文件
直接fastq-dump --split-3会报错unrecognized option: '--split-3'(用于分析的数据是双端测序数据,本次分析流程参照:知乎——「与国同庆,万字长文」ATAC-seq实战教程:从SRA数据下载到高分辨率论文主图绘制。可能从转换格式开始就出错了,初学着实找不到解决方法,若有大佬看到,希望可以帮忙解答一下,不胜感激。第一步写循环检测质量,为什么敲入代码后报错,不存在SSR文件呢?下载安装fastqc后进行质量分析。换成gzip之后可以得到gz文件。
2023-05-18 23:00:06
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空空如也
已提交NCBI的叶绿体基因组序列应该如何更新
2023-06-28
直接fastq-dump --split-3会报错
2023-05-19
prefetch2.9.6版本不能用,应该如何更新呢?或者怎么把它删除呢?
2023-05-16
发送邮件给NCBI更新叶绿体全基因序列
2023-05-13
叶绿体基因组核苷酸多态性分析选择序列的依据以及数量
2023-01-11
用Rstudio打开本地的IRscope是界面空白
2023-01-09
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