用fastq-dump --split-3 *将SSR文件转换为fastq文件

最新推荐文章于 2023-08-21 16:30:18 发布
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 直接fastq-dump --split-3会报错unrecognized option: '--split-3'（用于分析的数据是双端测序数据，本次分析流程参照：知乎——「与国同庆，万字长文」ATAC-seq实战教程：从SRA数据下载到高分辨率论文主图绘制徐寅生icon-default.png?t=N4HBhttps://www.zhihu.com/people/xu-yin-sheng-3）

换成gzip之后可以得到gz文件

下载安装fastqc后进行质量分析

第一步写循环检测质量，为什么敲入代码后报错，不存在SSR文件呢？

 可能从转换格式开始就出错了，初学着实找不到解决方法，若有大佬看到，希望可以帮忙解答一下，不胜感激

 

GXX8888
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