推荐一个基于opencv开源跨平台分析小动物视频活动和路径跟踪的程序

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本文主要介绍一种基于OpenCV的多平台程序可以可靠且可重复地跟踪啮齿动物或昆虫等小动物的运动，并量化包括距离和速度在内的动作参数，以便检测由于处理，环境富集或温度变化而引起的活动变化。该系统提供了一种准确且可重现的实验方法，具有潜力，可以在各种模型系统中对运动和行为进行简单，快速和灵活的分析。

介绍

大多数实验性体内手术模型或动物会导致影响行为和运动的生理效应。例如，诱发慢性疼痛或对光敏感可能在疾病的实验模型中代表有用的结果，但是如果不借助自动动物跟踪设备和复杂的分析系统，很难量化这些行为。这种调查依赖于选择适当的评估方法，并且通常受其限制。

现有方法在所收集的运动数据的质量，所选设备的设置简便性和总体吞吐量水平之间折衷。红外运动传感器可以在很少的监督下长时间部署，相比之下，使用多个高分辨率CCD相机可提供高质量的运动记录和分析，例如检测到微妙的步态异常，但是这种方法无法进行高效率的分析。存在类似的策略来量化幼虫期或成年期的昆虫运动，范围从手动计数交叉的网格到自动计数红外束的交叉和自动视频跟踪。为啮齿动物或昆虫使用专用的摄影台可以进行清晰的检测，但可能会干扰正常行为，同时会进一步增加进入障碍物，但是对于检测行为可能是必需的。可替代地，在家庭笼中拍摄自然运动目前需要专用的计算机和笼设置。专注于小动物行为的成熟机构可能会在这种复杂的系统中进行投资，但是，没有专门的基础设施，研究人员几乎无法利用这些方法轻松，灵活地测试运动或行为的可再现变化。

如何在家庭环境中的运动捕捉，作者基于开源OpenCV的应用程序进行了分析。该系统使用低成本的设备，易于安装，并且大多数动物研究人员已经可以使用。该应用程序的移动版本针对Android智能手机，安装和使用非常简单，不需要在独立计算机上处理文件，而台式机（PC / Mac / Linux）版本也可用于批量处理以下内容：来自任何数字记录设备的视频。我们发现，在使用家笼作为阶段时，小鼠具有很高的活性，这意味着该方法快速，可检测到活动性的变化。

结果和讨论

该研究项目演示了如何使用该程序对具有足够背景对比度的动物或物体进行数字化拍摄和评估，如工作流程示例（图 1）所示。