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RSS订阅原创 人工智能技术及在生物分子活性预测、药物发现中的应用
分类模型的实例讲解与练习，以给定数据集为例，采用摩根指纹和MACCS指纹，讲解基于KNN，RF和SVM的CYPs抑制剂相关毒性预测模型的构建与使用。以给定数据集为例，采用摩根指纹、MACCS指纹，及RDKit分子描述符，讲解NB，XGoost，SVM等微管蛋白预测模型的构建与使用。以给定数据集为例，使用 DNN，GCN，GAT等主流深度学习模型进行小分子抗乳腺活性分类预测研究，以重复文献为主，也会讲解乳腺预测的基本思路，逻辑和课题设想与实践。深度分子生成模型的操作实践，以CDK9和ATR靶点为案例。
2023-09-11 10:29:18
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原创 计算机辅助蛋白质结构分析、分子对接、片段药物设计技术与应用
1.1小分子结构构建 1.2 小分子理化性质（如分子量、clogP等）计算。（5）针对ACE2和新冠病毒Spike的蛋白晶体复合物，制作蛋白-蛋白相互作用。实例讲解与练习：激酶靶点Bcr/Abl抑制剂的构效关系模型构建与活性预测。（1）尼洛替尼与靶点的相互作用，列出相互作用的氨基酸，并导出结合模式图。实例讲解与练习：新冠病毒Spike蛋白及宿主蛋白ACE2的对接。实例讲解与练习：基于片段的Bcr/Abl靶点抑制剂优化与改造。实例讲解与练习：分别构建大环、氨基酸、DNA、RNA等分子。
2023-09-11 10:18:04
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原创 高通量虚拟筛选技术与中药/天然产物挖掘药效分子专题
实例讲解与练习：新冠病毒的表面刺突糖蛋白S蛋白（PDB ID-6VSB）高通量虚拟筛选实操，三轮分子对接大规模筛选的化合物库（高通量-标准精度-高精度）。实例讲解与练习：人周期蛋白依赖性激酶2（CDK2）与抑制剂staurosporine的复合物结构1AQ1为例。（2）人钠依赖性葡萄糖协同转运蛋白2（hSGLT2）的同源建模。（2）人钠依赖性葡萄糖协同转运蛋白2（hSGLT2）同源建模。（1）以PDB编号为1FJS的蛋白结构中的共结晶配体进行实操。案例分析与实操讲解：（1）以辣椒素受体TRPV1作为靶标，
2023-09-11 10:00:30
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空空如也
空空如也
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