linux grep命令Ff和wf从两个文件中提取相同内容的行

首先——grep -Ff

text1：

chr1    1304143
chr1    1304787
chr1    1305007
chr1    1305066
chr1    1305096
chr1    1508459

text2：

chr1    1305066
chr1    1305096
chr1    1508459
chr1    1304143
chr1    1304787

chr1    1305007

输出text2中和text1中相同的行

grep -Ff text1 text2

结果：

chr1    1305066

chr1    1305096
chr1    1508459

输出text1中和text2中不同的行

grep -vFf text2 text1

grep -Ff只能用于两个文件中一整行内容都相同的结果的查找，速度较快，但是遇到一行中部分内容相同的情况就处理不了，所以就有了grep -wf。

其次——grep -wf

TEXT1：

chr1    5751347 A       G
chr1    6212408 G       A 
chr1    6261871 G       A
chr1    1304143 A       G
chr1    1304787 G       A
chr1    1305007 C       T
chr1    1305066 T       C

TEXT2:

chr1    2010548
chr1    2010570
chr1    2974742
chr1    1304787 
chr1    1305007 

chr1    1305066

输出TEXT1和TEXT2中相同内容的行

grep -wf TEXT1 TEXT2

结果：

chr1    1304787 G       A
chr1    1305007 C       T
chr1    1305066 T       C