python核心编程之Python聚类算法之凝聚层次聚类实例分析

这篇文章主要介绍了Python聚类算法之凝聚层次聚类的原理与具体使用技巧,具有一定参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
本文实例讲述了Python聚类算法之凝聚层次聚类。分享给大家供大家参考，具体如下：

凝聚层次聚类：所谓凝聚的，指的是该算法初始时，将每个点作为一个簇，每一步合并两个最接近的簇。另外即使到最后，对于噪音点或是离群点也往往还是各占一簇的，除非过度合并。对于这里的“最接近”，有下面三种定义。我在实现是使用了MIN，该方法在合并时，只要依次取当前最近的点对，如果这个点对当前不在一个簇中，将所在的两个簇合并就行：

单链(MIN):定义簇的邻近度为不同两个簇的两个最近的点之间的距离。
全链(MAX):定义簇的邻近度为不同两个簇的两个最远的点之间的距离。
组平均：定义簇的邻近度为取自两个不同簇的所有点对邻近度的平均值。

 scoding=utf-8
# Agglomerative Hierarchical Clustering(AHC)
import pylab as pl
from operator import itemgetter
from collections import OrderedDict,Counter
points = [[int(eachpoint.split('#')[0]), int(eachpoint.split('#')[1])] for eachpoint in open("points","r")]
# 初始时每个点指派为单独一簇
groups = [idx for idx in range(len(points))]
# 计算每个点对之间的距离
disP2P = {}
for idx1,point1 in enumerate(points):
  for idx2,poi