python核心编程之Python聚类算法之凝聚层次聚类实例分析

这篇文章主要介绍了Python聚类算法之凝聚层次聚类的原理与具体使用技巧,具有一定参考借鉴价值,需要的朋友可以参考下
本文实例讲述了Python聚类算法之凝聚层次聚类。分享给大家供大家参考,具体如下:

凝聚层次聚类:所谓凝聚的,指的是该算法初始时,将每个点作为一个簇,每一步合并两个最接近的簇。另外即使到最后,对于噪音点或是离群点也往往还是各占一簇的,除非过度合并。对于这里的“最接近”,有下面三种定义。我在实现是使用了MIN,该方法在合并时,只要依次取当前最近的点对,如果这个点对当前不在一个簇中,将所在的两个簇合并就行:

单链(MIN):定义簇的邻近度为不同两个簇的两个最近的点之间的距离。
全链(MAX):定义簇的邻近度为不同两个簇的两个最远的点之间的距离。
组平均:定义簇的邻近度为取自两个不同簇的所有点对邻近度的平均值。

 scoding=utf-8
# Agglomerative Hierarchical Clustering(AHC)
import pylab as pl
from operator import itemgetter
from collections import OrderedDict,Counter
points = [[int(eachpoint.split('#')[0]), int(eachpoint.split('#')[1])] for eachpoint in open("points","r")]
# 初始时每个点指派为单独一簇
groups = [idx for idx in range(len(points))]
# 计算每个点对之间的距离
disP2P = {}
for idx1,point1 in enumerate(points):
  for idx2,point2 in enumerate(points):
    if (idx1 < idx2):
      distance = pow(abs(point1[0]-point2[0]),2) + pow(abs(point1[1]-point2[1]),2)
      disP2P[str(idx1)+"#"+str(idx2)] = distance
# 按距离降序将各个点对排序
disP2P = OrderedDict(sorted(disP2P.iteritems(), key=itemgetter(1), reverse=True))
# 当前有的簇个数
groupNum = len(groups)
# 过分合并会带入噪音点的影响,当簇数减为finalGroupNum时,停止合并
finalGroupNum = int(groupNum*0.1)
while groupNum > finalGroupNum:
  # 选取下一个距离最近的点对
  twopoins,distance = disP2P.popitem()
  pointA = int(twopoins.split('#')[0])
  pointB = int(twopoins.split('#')[1])
  pointAGroup = groups[pointA]
  pointBGroup = groups[pointB]
  # 当前距离最近两点若不在同一簇中,将点B所在的簇中的所有点合并到点A所在的簇中,此时当前簇数减1
  if(pointAGroup != pointBGroup):
    for idx in range(len(groups)):
      if groups[idx] == pointBGroup:
        groups[idx] = pointAGroup
    groupNum -= 1
# 选取规模最大的3个簇,其他簇归为噪音点
wantGroupNum = 3
finalGroup = Counter(groups).most_common(wantGroupNum)
finalGroup = [onecount[0] for onecount in finalGroup]
dropPoints = [points[idx] for idx in range(len(points)) if groups[idx] not in finalGroup]
# 打印规模最大的3个簇中的点
group1 = [points[idx] for idx in xrange(len(points)) if groups[idx]==finalGroup[0]]
group2 = [points[idx] for idx in xrange(len(points)) if groups[idx]==finalGroup[1]]
group3 = [points[idx] for idx in xrange(len(points)) if groups[idx]==finalGroup[2]]
pl.plot([eachpoint[0] for eachpoint in group1], [eachpoint[1] for eachpoint in group1], 'or')
pl.plot([eachpoint[0] for eachpoint in group2], [eachpoint[1] for eachpoint in group2], 'oy')
pl.plot([eachpoint[0] for eachpoint in group3], [eachpoint[1] for eachpoint in group3], 'og')  
# 打印噪音点,黑色
pl.plot([eachpoint[0] for eachpoint in dropPoints], [eachpoint[1] for eachpoint in dropPoints], 'ok')  
pl.show()

运行效果截图如下:在这里插入图片描述

推荐我们的Python学习扣qun:913066266 ,看看前辈们是如何学习的!从基础的python脚本到web开发、爬虫、django、数据挖掘等【PDF,实战源码】,零基础到项目实战的资料都有整理。送给每一位python的小伙伴!每天都有大牛定时讲解Python技术,分享一些学习的方法和需要注意的小细节,点击加入我们的 python学习者聚集地

参与评论 您还未登录,请先 登录 后发表或查看评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
©️2022 CSDN 皮肤主题:深蓝海洋 设计师:CSDN官方博客 返回首页

打赏作者

haoxun03

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
输入1-500的整数
余额支付 (余额:-- )
扫码支付
扫码支付:¥2
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、C币套餐、付费专栏及课程。

余额充值