docker常用命令:
e86e1d49fcc1 是多组学的docker
8ae77c64e090是protein的docker
查看所有容器名字:
sudo nvidia-docker ps -a
有的时候这个nvidia-docker不好使 就需要用下面这行参数
调动gpu+路径映射
docker run --name scmhnn --gpus all -it -v /home/liwei:/home/data nkuweili/scmhnn:latest /bin/bash
将下载好的镜像容器化:
sudo nvidia-docker run -it 镜像id bash
将路径进行映射:(一般只需要这一步 就可以替代上一步的run 如果直接容器化似乎就不能再进行磁盘的映射了)
sudo nvidia-docker run -it -v 原系统路径:新的路径 镜像id bash
(原来的路径 /data/home/allenwli)
(新的路径 /home/data)
如果退出 需要start
sudo nvidia-docker start 容器名字
sudo nvidia-docker exec -it 容器名字 bash
删除容器:
首先需要stop:
sudo nvidia-docker stop 容器名字
然后进行rm:
sudo nvidia-docker rm 容器id
8ae77这个taiji的环境配置了torch_geometric
如果需要挂载其他同学或者老师的位置 需要重新run一个镜像
sudo nvidia-docker run -it -v /data/home/allenwli:/home/data --privileged fd403e7838b7 bash
就是在run的时候后面加上这个privileged参数
(似乎想要挂载别人的路径必须要在容器里才可以)
然后挂载的命令:
mkdir -p /aaa/fionafyang/datasets && mount -t ceph 100.110.19.213,9.46.134.130,9.46.134.140:/fionafyang/datasets /aaa/fionafyang/datasets -o name=fionafyangdatasets,secret=AQAyMwlgeO5FMBAAzK7XX2vLZJagDs6RVPXAMw==
e86e1d49fcc1
这个容器里可以访问数据集的ppi
ft将服务器文件down到本地
ft put 文件名or文件夹名字 D:/Desktop