perl 提取介于某个区间的几行文字(转)

 

提取介于某个区间的几行文字


flw原话:


这是面向行处理的一种轻量级解决方法。
比那些对整个文件进行模式匹配的方法不知优雅了要多少倍。

$start 表示开始标记的模式,$end 表示结束标记的模式,
if ( (/$start/ .. /$end/) and !/$end/ ){
表示需要开始和结束之间的,但不需要结束的那一行。

#!/usr/bin/perl

use warnings;
use strict;

open (INFILE,"/home/liuguiyou/qujian.txt") or die "Cannot open the inputfile: $!/n";
open (OUTFILE,">/home/liuguiyou/result.txt")or die "Cannot open the outputfile: $!/n";

while(<INFILE>){
if(/>chromosome01/../>chromosome02/ and !/>chromosome02/ ){
      print OUTFILE "$_";
                                    }

                }

exit;

[liuguiyou@localhost ~]$ more  qujian.txt
>chromosome01 Indica cv. 93-11
CTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAA
CCCTAAACCCTAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACAGCT
GACAGTACGATAGATCCACGCGAGAGGAACCGGAGAGACAACGGGATCCAGGCGCCAGCG
>chromosome02 Indica cv. 93-11
CTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAA
CCCTAAACCCTAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACAGCT
GACAGTACGATAGATCCACGCGAGAGGAACCGGAGAGACAACGGGATCCAGGCGCCAGCG
>chromosome03 Indica cv. 93-11

运行完以后:



>chromosome01 Indica cv. 93-11

CTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAA

CCCTAAACCCTAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACAGCT

GACAGTACGATAGATCCACGCGAGAGGAACCGGAGAGACAACGGGATCCAGGCGCCAGCG
  • 0
    点赞
  • 3
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值