注1:关于Rserve网上有很多资料可以参考,详细情况可以参考博客下面的“参考资料”部分,本文只是简单介绍一下Rserve,主要目的是记录一下Java远程执行R脚本文件的方法。
注2:这里提到的远程执行R脚本文件的方式都是R脚本存在于Rserve服务端,如果R脚本文件存在客户端,可以使用RUtils工具包:http://blog.csdn.net/zhyh1986/article/details/13065199
Rserve介绍
Rserve是一个基于TCP/IP协议的,允许R语言与其他语言通信的C/S结构的程序,支持C/C++,Java,PHP,Python,Ruby,Nodejs等。 Rserve提供远程连接,认证,文件传输等功能。我们可以设计R做为后台服务,处理统计建模,数据分析,绘图等的任务。
详细介绍请参照官方网站:https://rforge.net/Rserve/
Rserve安装
Linux系统下建议使用root权限安装。下面的内容是依据Windows7系统中安装过程进行描述的。
进入R语言解释器:R
安装命令:install.packages(“Rserve”)
然后安装程序会提示我们选择下载镜像,提示如下:
— Please select a CRAN mirror for use in this session —
等我们选择了镜像后(测试时选择的是China(xxx)),安装程序便进行下载安装,最终会输出如下的信息(Linux下的输出信息或有不同):
说明Rserve安装成功,安装路径为:%R_HOME%libraryRserve目录。
启动Rserve服务
在Windows命令窗口进入R_HOMElibraryRservelibsi386目录中执行如下命令(我的Windows7是32位的,如果是64位系统对应目录为R_HOMElibraryRservelibsx64):
R CMD Rserve
复制代码
R将作出如下应答:
说明Rserve启动成功(端口6311),可以进行连接测试了。
上面的启动命令使用的本地模式,如果想远程连接需要增加参数 –RS-enable-remote
即启动命令为:
R CMD Rserve --RS-enable-remote
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Java远程连接Rserve
下载依赖jar包,地址:http://www.rforge.net/Rserve/files/
共两个jar包,下载完成后将它们加入到项目的classpath中即可:
REngine.jar
RserveEngine.jar
也可以到Rserve安装目录中寻找,比如:R_HOME libraryRservejava目录中就有相关jar包,名字略有不同,经测试可以使用:
简单的测试代码:
package com.zyh.up.general.rjava;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;
public class RserveBegin {
public static void main(String[] args) {
try {
callRserve();
} catch (RserveException e) {
e.printStackTrace();
} catch (REXPMismatchException e) {
e.printStackTrace();
}
}
static void callRserve() throws RserveException, REXPMismatchException {
RConnection rConnection = new RConnection("192.168.101.122");
String rv = rConnection.eval("R.version.string").asString();
System.out.println(rv);
double [] arr = rConnection.eval("rnorm(10)").asDoubles();
for(double d : arr) {
System.out.println(d);
}
}
}
复制代码
测试可以通过,程序将输出R语言版本信息及10个Double类型的数字。
Java远程执行R脚本
上面的示例只是执行R命令,但如果我们在服务器上放置R脚本又该如何执行该脚本或调用其中的函数呢?
有两种方法可以完成上面的问题。
假如我们定义了一个R脚本area.R,其中定义了一个方法area,该方法接收一个半径值然后计算对应面积并返回,脚本内容非常简单:
area<-function(r){pi*r^2}
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下面描述一下如何调用这个脚本中的area函数,并获取其返回值。
第一种方法就是直接用source函数将area.R脚本加载上来,然后就可以像调用R语言内置命令/函数一样调用脚本中的area方法了。这样做有一个缺点就是每建立一次Java与R之间的连接就需要调用source函数一次。
示例代码:
package com.zyh.up.general.rjava;
import org.rosuda.REngine.REXP;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;
public class RserveBegin {
public static void main(String[] args) {
try {
callRScript();
} catch (Exception e) {
e.printStackTrace();
}
}
static void callRScript() throws RserveException, REXPMismatchException {
RConnection rc = new RConnection("192.168.101.122");
// source函数需要给出R脚本路径, 注意传入转义的引号
rc.eval("source("/home/hadoop/wangfeng/javaR/area.R")");
REXP rexp = rc.eval("area(10)");
System.out.println("Area of 10 is " + rexp.asDouble());
}
}
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代码测试通过。
另一种调用R脚本的方法是通过Rserv.conf配置文件,该文件路径为/etc/Rserv.conf,如果文件不存在则创建一个新的,然后在文件中添加如下的代码:
source /home/hadoop/wangfeng/javaR/area.R
复制代码
然后重新启动Rserve服务即可。
使用这种方式Java测试代码需要去掉source语句这一行,即:
rc.eval("source("/home/hadoop/wangfeng/javaR/area.R")");
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其它不变,经测试成功。
注1:第二种方式只在Linux下采用,Win平台对应的方法没有找到。
另外:有些人说配置文件为Rserve.conf,但我在122的/etc下找到的是Rserv.conf,不管是哪一个文件(甚至两者都不是,随便命名一个),只要执行下面命令告诉Rserve配置文件是哪一个即可(需要重启Rserve):
R CMD Rserve --RS-conf Rserv.conf
复制代码
参考资料
https://rforge.net/Rserve/example.html
http://blog.fens.me/r-rserve-java/
http://www.studytrails.com/R/RServe/RServe-Source-R-File.jsp
http://stackoverflow.com/questions/13553397/sourcing-r-files-only-once-on-rserve