![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756918.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
bioinformatics
文章平均质量分 77
HUGEHEADHUGE
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
动态编程之序列比对:Needleman-Wunsch 算法和Smith-Waterman算法
动态编程之序列比对:Needleman-Wunsch 算法和Smith-Waterman算法 在比对两个序列时,不仅要考虑完全匹配的字符,还要考虑一个序列中的空格或间隙(或者,相反地,要考虑另一个序列中的插入部分)和不匹配,在序列比对中,需要找到最优的比对(最转载 2011-04-17 18:18:00 · 33022 阅读 · 5 评论 -
得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别
对于蛋白质序列,计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度,一旦这个矩阵定义好了以后,比对程式就可以利用这个矩阵,尽量将相似的残基排在一起,以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种,第一种就是PAM(Point Accepted Multation),另一种就原创 2011-04-17 19:59:00 · 13296 阅读 · 0 评论 -
T检验、F检验和统计学意义(P值或sig值)
http://blog.znsun.com/2008/04/653/t-test-and-f-test-and-p-or-sig-value1.T检验和F检验的由来 一般而言,为了确定从样本(sample)统计结果推论至总体时所犯错的概率,我们会利用统计学家所开发的一些统计方法,进行统计检定。 通过把所得到的统计检定值,与统计学家建立了一些随机变量的概率分布转载 2011-06-30 14:59:00 · 4310 阅读 · 0 评论 -
生物信息学学习感悟
http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=43321&do=blog&id=292068生物信息学,是一门综合学科。涉及到数学,生物学和计算机的内容。但在我看来,计算机的基础需要,但要求不是很高,关键是要有很好转载 2011-08-05 14:11:25 · 5820 阅读 · 1 评论 -
GEO : Affymetrix CEL文件 CDF文件 R语言处理方法
我竟然开始在csdn上贴生物文章了,我还真是个银才背景介绍:1)Affymetrix: Affymetrix的探针(proble)一般是长为25碱基的寡聚核苷酸;探针总是以perfect match 和mismatch成对出现,其信号值称为PM和MM,成对的p原创 2011-05-22 16:09:00 · 21362 阅读 · 1 评论