GEO : Affymetrix CEL文件 CDF文件 R语言处理方法

我竟然开始在csdn上贴生物文章了，我还真是个银才

背景介绍：
1）Affymetrix：
     Affymetrix的探针（proble）一般是长为25碱基的寡聚核苷酸；探针总是以perfect match 和mismatch成对出现，其信号值称为PM和MM，成对的perfect match 和mismatch有一个共同的affyID。
     CEL文件：信号值和定位信息。
     CDF文件：探针对在芯片上的定位信息
      Affymetrix exon array ：Affymetrix的外显子芯片
2）exonmap包：
      用来分析Affymetrix的外显子芯片（需要用到affy包）。(http://www.bioconductor.org/packages/2.0/bioc/html/exonmap.html；http://rss.acs.unt.edu/Rdoc/library/exonmap/html/00Index.html）
3) af