hujian219的专栏

最近要做一个项目需要使用RNA-SeQC.jar包 对基因测序结果进行分析。 1.参数输入 -n 1000 -s \"TestId|ThousandReads.bam|TestDesc\" -t gencode.v7.annotation_goodContig.gtf -r Homo_sapiens_assembly19.fasta -o ./testReport/ -strat gc -...

4.初始化RNASeqMetrics对象     主要代码         metrics.prepareOptionsFromCommandLine(cl);        主要任务为将输入参数注入RNASeqMetrics对象，同时新建输出目录（根据 -o参数）。     根据 gtf 生成 refGene.txt文件     如果 rRNA 参数没有 则生成 rRNA_inte...