ShengBTE安装processes. f90报错的解决办法

已于 2024-07-16 14:31:52 修改
阅读量530 收藏 1
点赞数
CC 4.0 BY-SA版权
文章标签： ffmpeg
于 2023-06-09 02:37:49 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/icehoqion/article/details/131119066
文章讲述了在安装ShengBTE时遇到processes.f90文件报错的问题，主要是由于在FFLAGS参数中缺少了-qonmp导致。作者建议在arch.make文件中保留这个参数以正确编译并避免错误。更新的安装教程对于按照旧版教程操作的用户可能不适用，需注意软件作者的最新更改。

经验分享

在前文中介绍了有关ShengBTE的内容以及安装方法ShengBTE简单介绍、安装与使用，近期有小伙伴联系笔者说在安装ShengBTE时出现报错，主要为

processes. f90出了点问题，说对于代码147行中的“omp_get_thread_num”存在“this name does not have a type,and must have an explicit type”

 相关读者是根据链接介绍，转去ShengBTE作者的网站下载的最新版的安装包。软件作者在今年有对软件进行更新

而我早起安装教程是依据旧版，在2022年1月份完成，所以依据我去年的教程安装最新版的软件会出现一些原本不该发生的问题，但笔者当时已经说明了具体修改的思路，如果按照此思路来的话也是可以避免出错的（甩锅）。

在arch.make.example文件中软件作者更新了一些参数，尤为重要的是在FFLAGS后添加了一个-qonemp，而参照我的教程的小伙伴不少将其去掉，

这就导致了在编译processes. f90文件时，部分条件未指定的问题。

在软件安装的过程中可在arch.make保留此参数并进行下一步，即可使软件正常安装。

ShengBTE简单介绍、安装与使用

​

愿有所成

引喻失义   妄自菲薄

VASP结合vaspkit+ShengBTE计算热电优值（二）
weixin_44873868的博客
04-20 1992
注意BTE.kappa_tensor文件中，每列对应的方向顺序分别为XX,XY,XZ,YX,YY,YZ,ZX,ZY,ZZ.且最后一行为有效的收敛值，使用时只需要取最后一行。这两种方法的计算结果都是可用的。原子层厚度=POSCAR 真空层方向相距最远的两个原子的范德华半径之和+POSCAR 真空层方向相距最远的两个原子的距离。目前有两种方法计算电子热导率，一种是使用BoltzTraP计算得到的电子热导减去TσS2。因此要计算ZT值，我们需要分别计算电导率σ，塞贝克系数S，电子热导率κe，晶格热导率κc。
lapack安装_Linux安装ShengBTE(以本人超算为例）
weixin_39625747的博客
12-03 1140
第一步：去此网址下载ShengBTE(https://bitbucket.org/sousaw/shengbte)上传至安装目录:/lustre/ISSP2/xm/software;安装好spglib，比如我的目录：/lustre/ISSP2/xm/software/sousaw-thirdorder-b6962b2088ec/spglib第二步：根据arch.make.example编辑arch...
shengBTE计算热导率数值不对的可能原因
odin_linux的博客
04-11 2535
如使用cp2k计算力常数，通常使用QE等平面波软件，对于超胞体系，随着扩胞，在较大的截断半径下，所需计算量非常大，使用CP2K中的QS模块也能进行第一性原理计算，具有相对较高的计算效率，但是CP2K不同于平面波的QE等，计算中仅有gamma点计算，需要采用实空间较大超胞，如果使用和QE等相同的超胞，则会导致原子受力精度不高，一般在~0.0003Rh/bohr^2量级的误差，也会对某些体系，特别是二维体系的热导率有很大的影响。2.shengBTE的control文件中晶格参数单位默认nm，有转换系数的参数；
Fourthorder:与shengBTE中的thirdorder.py类似，开发了Fourthorder.py以计算四阶原子间力常数（4th-IFC）。 请在FourPhonon存储库的“讨论”部分中发布您的问题
05-15
四阶 Zherui韩枭阳吴莉天利锋秀林阮 四阶脚本源自三阶脚本，用于帮助[包含四声子模块的ShengBTE]用户以高效便捷的方式创建FORCE_CONSTANTS_4TH文件。 更具体地说，它执行两项任务： 它解析出一组不可约的原子位移，从中可以计算出完整的非谐四阶原子间力常数（IFC）矩阵。 置换后的超级单元将保存到输入文件中，该文件可输入到第一性原理DFT代码中，以计算原子位移产生的力。 当前支持的DFT代码是VASP（Fourthorder_vasp.py）和Quantum ESPRESSO（Fourthorder_espresso.py）。 从DFT代码创建的输出文件中，Fourthorder重构完整的四阶IFC矩阵，并将其以正确的格式写入FORCE_CONSTANTS_4TH。 汇编 四阶是一组Python脚本。 它是使用Python 2.7.3开发的，但应该可以使用稍旧的
ShengBTE简单介绍、安装与使用
DFT_M的博客
09-11 6477
在ShengBTE和thirdorder安装文件中均带有其“使用说明书”，且都命名为README.md，里面有一些基本的安装、使用介绍，尤其是一些参数的介绍，初学者在使用之前要认真阅读并理解，对以后遇到问题有很大帮助，这也是对于软件的最基础的了解。这里主要是补充了我们make编译出的libsymspg.a文件的路径，以及更改了编译器为mpiifort，在下方也调整了MKL的配置，大家在安装的时候可以复制上方的内容，手动更改libsymspg.a文件的路径，然后可以尝试进行安装。
bin_io.f90.rar_3d fdtd matlab pml_PML FDTD_bin_io.f90_fdtd三维_三维p
07-15
标题中的"bin_io.f90.rar_3d fdtd matlab pml_PML FDTD_bin_io.f90_fdtd三维_三维p"揭示了这个压缩包的内容主要涉及的是一个名为"bin_io.f90"的Fortran源代码文件，用于处理三维FDTD（Finite-Difference Time-Domain...
tiaohefenxi.f90.zip_matlab潮差_plates8hr_untild5w_潮差计算_潮汐调和分析
09-21
在这个“tiaohefenxi.f90.zip”压缩包中，包含了一个名为“tiaohefenxi.f90”的文件，这可能是一个用Fortran编程语言编写的源代码，专门用于进行潮汐调和分析。Fortran是一种广泛用于科学计算的语言，其高效性和数值...
umfpack.f90 5.6.2 Fortran
12-14
umfpack.f90- 5.6.2 Fortran
fvcom_f90.rar_FVCOM xiazai_FVCOM-SWAVE_fvcom_fvcom3.1_mht. f90
09-22
在提供的“fvcom_f90.rar”压缩包中，我们重点关注的是FVCOM的“fvcom-swave”模块和其中的“fvcom3.1”版本。这个压缩包内含的“fvcom_fvcom3.1_mht. f90”源代码文件，是FVCOM核心计算的一部分，用于处理波浪相关...
OC.rar_OC materials_OC matsmin.F90_OpenCalphad_材料计算
09-22
《OC材料计算：深入探索OpenCALPHAD与OC matsmin.F90源代码》 在材料科学研究领域，相图计算是理解多组元系统热力学性质、预测材料性能及指导新材料设计的重要工具。OpenCALPHAD（Open Source CALPHAD）是一种广泛...
sousaw-ShengBTE-Kit.zip
01-20
ShengBTE
phonopy制作shengBTE的FORCE_CONSTANTS_2ND
odin_linux的博客
11-29 2413
通过phonopy制作shengBTE的2阶力常数文件，如果shengBTE运行时出现： “wrong number of force constants for the specified scell” 这是因为phonopy输出的FORCE_CONSTANTS中考虑了对称性，不是完整的FORCE_CONSTANT，即里面应该有 超胞原子数*超胞原子数 组2阶力常数文件，可以打开生成的FORCE_CONSTANT文件，看第一行出现的两个数字是否是超胞内的总原子数。 如果不是，为了生成完整的FORCE
热输运物性的理论计算方法
odin_linux的博客
03-14 2585
在固体物理中，除了大家广泛关注的电子结构和光电性质等物理性质外，晶格中热流输运和调控也是至关重要的一个方面，这不仅影响微纳器件的散热问题，同时在热电等领域的应用中，较低的材料热导率是影响热电转换效率的重要因素。这里简单汇总目前能够开展热输运计算的程序平台、原理和使用方法： 1.shengBTE 基于第一性原理的声子玻尔兹曼输运方程法，本质是基于玻尔兹曼输运方程，这个方程其实是空间热流守恒的微分方程，其中微分点处的热流会聚等于该处声子散射等造成的热流消减。求解这个方程，需要知道声子散射等的寿命，基于三声子
thirdorder安装报错：error: command ‘/usr/bin/gcc‘ failed
DFT_M的博客
01-29 1062
笔者前段时间拿到一台新的服务器，与以往一样通过安装Anaconda来构建python环境，在安装thirdorder的时候遇到了相关的报错，最终确定是python版本的问题。中提及了与之相关的软件thirdorder的安装教程，后续收到很多朋友询问说thirdorder安装总出现各种各样的问题。文件，这个是安装成功的标志，同时如果之前安装报错可能也会生成，但并不能使用软件，再次安装之前要把旧的.so文件删除再安装。应该是软件的版本太新，所以和thirdorder安装文件的要求有所冲突。
基于VASP+phonopy+shengbte计算声子相干的热学性质
热门推荐
weixin_44873868的博客
01-08 1万+
声子相干的热学性质在计算材料领域有着非常重要的地位，我们可以通过第一性原理计算得到任一种晶体的热力学性质，但是很多小伙伴尤其是初学者还比较陌生，本文介绍基于DFT计算与声子相关的性质，是用VASP+phonopy+shengbte计算一种材料的声子谱，声子态密度，热力学性质（包括准简谐近似下的亥姆霍子自由能，等压热容Cp，热膨胀系数，格林爱森参数，和考虑高阶声子的声子散射，群速度，声子自由程，热导率等等）共分为如下几个部分： (1). 生成4个输入文件: POSCAR POTCAR INCAR..
bash+vasp+ShengBTE自动计算材料热运输性质脚本
DFT_M的博客
06-08 3335
之前我们已经详细介绍了ShengBTE软件与其安装教程，详细请查看ShengBTE简单介绍、安装与使用由于在计算三阶力学常数时，根据扩胞比例以及近邻原子受力情况的不同，生成的3RD.POSCAR数量也尽不相同，笔者最近一次的计算总共计算了700+个任务，如果在此过程中手动布置任务则费时费力，效率低下。而在后续的ShengBTE计算时，通过bash脚本进行任务布置也可以实现多任务顺序计算，节省精力与时间。本文针对材料的热输运性质计算主要参考天玑算所提供的教程，详细请见https://phadwiki.com/
VASP结合vaspkit+ShengBTE计算热电优值（一）
weixin_44873868的博客
01-13 2628
使用 vaspkit-681命令生成高密度的KPOINTS，然后进行静态计算 （注意只有使用这项功能生成KPOINTS计算的结果才能继续使用vaspkit命令计算下一步，使用M-S方法自动生成K点的计算结果无法进行下一步）。这一步一般需要非常长的时间去进行计算，因此扩胞的大小可以稍微比二阶力常数矩阵的计算时的大小小一点。其中Phonopy用于计算声子谱及二阶力常数，Thirdorder用于计算三阶力常数，ShengBTE用于结合前面两者的结果计算晶格热导率。准备好计算的材料对应的POSCAR。
FORTRAN 写代码过程中遇到的问题记录1
qq_42520237的博客
06-18 1654
新手学习编写Fortran代码过程中遇到的问题记录
thirdorder高版本anaconda3的安装教程
DFT_M的博客
03-22 1145
笔者前段时间拿到一台新的服务器，与以往一样通过安装Anaconda来构建python环境，在安装thirdorder的时候遇到了相关的报错，最终确定是python版本的问题。的文章中提及了与之相关的软件thirdorder的安装教程，后续收到很多朋友询问说thirdorder安装总出现各种各样的问题。安装好thirdorder所需要的环节依赖比如spglib和scipy等等,依靠pip进行安装。在安装thirdorder时先设置一个新的python环境,并设置python=3.7。
linux系统运行.f90文件
最新发布
06-22
<think>我们正在回答用户关于在Linux系统中编译和运行.f90Fortran文件的问题。根据提供的引用，我们可以总结出几种方法，包括直接使用编译器命令、使用Makefile等。注意：用户可能需要安装Fortran编译器，如gfortran或ifort（IntelFortran）。我们将按照以下步骤组织回答：1.安装Fortran编译器（如果尚未安装）2.使用编译器直接编译单个文件3.编译多个文件4.使用Makefile进行编译（可选，适用于较复杂的项目）5.运行编译后的可执行文件同时，我们将根据要求生成相关问题。注意引用标记：我们引用了用户提供的引用内容，但要注意这些引用内容是关于Fortran编译的，所以我们在回答中适当引用。另外，用户要求使用中文回答，并且注意数学公式和代码块的格式。</think>### 在Linux系统中编译和运行Fortran (.f90) 文件的方法 #### 1. **安装Fortran编译器** 首先确保已安装Fortran编译器： ```bash # 安装gfortran（GNU Fortran编译器） sudo apt-get install gfortran # 或安装Intel Fortran编译器（需官网获取安装包） # 参考：[^3] ``` 验证安装： ```bash gfortran --version ifort --version # 若安装Intel编译器 ``` #### 2. **编译单个文件** - **基本编译** 将 `hello.f90` 编译为可执行文件 `hello`： ```bash gfortran -o hello hello.f90 # 使用gfortran ifort -o hello hello.f90 # 使用Intel ifort [^1] ``` - `-o` 指定输出文件名（默认为 `a.out`） - **启用优化** 添加优化标志提高性能： ```bash gfortran -O3 -o hello hello.f90 # -O3为最高优化级别 ``` #### 3. **编译多个文件** 当项目包含多个文件（如 `mod.f90` 和 `main.f90`）： ```bash # 一步编译（推荐） gfortran -o program mod.f90 main.f90 [^1] # 分步编译（适用于大型项目） gfortran -c mod.f90 # 生成mod.o gfortran -c main.f90 # 生成main.o gfortran -o program mod.o main.o # 链接 ``` #### 4. **运行程序** 执行生成的可执行文件： ```bash ./hello # 运行名为hello的程序 ./program # 运行多文件编译的程序 ``` #### 5. **高级用法** - **OpenMP并行** 启用并行计算（需代码支持）： ```bash gfortran -fopenmp -o parallel parallel.f90 [^4] ``` - **Makefile管理** 创建 `Makefile` 自动化编译（示例）： ```makefile FC = gfortran FFLAGS = -O3 TARGET = program OBJS = mod.o main.o $(TARGET): $(OBJS) $(FC) $(FFLAGS) -o $@ $^ %.o: %.f90 $(FC) -c $< [^4] ``` 执行 `make` 即可编译。 --- ### 关键注意事项 1. **文件扩展名** - `.f90` 表示自由格式Fortran源码（区分大小写）。 2. **依赖顺序** 编译多文件时，被调用的模块需先编译（如 `mod.f90` 在 `main.f90` 前）[^1]。 3. **错误排查** - 语法错误：编译器会显示错误位置。 - 段错误：检查数组越界或未初始化变量[^2]。 > 示例：简单Fortran程序 `hello.f90` > ```fortran > program hello > print *, "Hello, Linux Fortran!" > end program hello > ``` > 编译运行： > ```bash > gfortran -o hello hello.f90 > ./hello > ``` ---
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值