schordinger动力学MD过程记录（非跨膜蛋白不加膜）

于 2023-02-20 10:47:24 发布
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分类专栏： AI与生药 文章标签： ai
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版权

1.拥有一个【对接完成的】的蛋白+配体并选中

在这里插入图片描述

2.System Builder

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设置好就可以RUN了

3.run，并得到system builder的输出结果

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

在这里插入图片描述

4.选中带有system builder的输出结果文件，进行Molecular Dynamics

在这里插入图片描述

5.完成MD，分析结果：Simulation interactions Diagram

在这里插入图片描述

load文件，选择MD输出的out.cms或者eaf文件都可以，如果上一步勾选了跑完分析，会有eaf，直接加载数据即可。

小水草的小跟班
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