Google colab安装环境

import torch
print(torch.__version__)
print(torch.cuda.is_available())

第一步先检查cuda是否能用

!unzip /content/GraphDTA-master.zip

第二步:解压我的文件

!wget -c https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh
!chmod +x Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh
!time bash ./Miniconda3-py37_4.9.2-Linux-x86_64.sh -b -f -p /usr/local
!time conda install -q -y -c conda-forge rdkit
 
import sys
sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/')

第三步:安装Miniconda,和rdkit

!conda install scipy
!conda install nexworkx

第四步:安装一些必要的包

!pip install torch-geometric \
  torch-sparse==latest+cu101 \
  torch-scatter==latest+cu101 \
  torch-cluster==latest+cu101 \
  -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.4.0.html

第五步:安装torch-geometric一些包

!pip install torch===1.4.0 torchvision===0.5.0 -f https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html

第六步:重新安装torch

第七步:把云盘的文件上传到colab

from google.colab import drive
drive.mount("/content/drive",force_remount=True)

第八步:使用tensorboard查看可视化

!pip install tensorboardX
%load_ext tensorboard 
%tensorboard --logdir=/content/drive/MyDrive/HpyerAttentionDTI-main/

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### 回答1: 在Colab安装Anaconda是一个简单的过程。首先,要确保你有一个Google账户并打开Colab网站。接下来,创建一个新的Colab笔记本或者打开一个已存在的笔记本。 在笔记本中,首先需要安装Miniconda,因为这是Anaconda的精简版本,大小较小且安装速度较快。通过运行以下代码来安装Miniconda: ``` !wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh !bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -bfp /usr/local !conda install -q -y --prefix /usr/local python=3.7 ``` 以上代码的含义是:首先使用wget下载最新的Miniconda安装脚本,然后使用bash运行脚本并安装到目标文件夹/usr/local中,最后使用conda命令安装Python 3.7。 接下来,将Anaconda添加到系统路径中,这样我们就可以在Colab中使用它。运行以下代码: ``` import sys sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/') ``` 这将确保Colab可以找到Anaconda安装路径中的库文件。 安装完成后,你就可以使用Anaconda提供的各种功能了,例如创建和管理Python环境安装各种Python包等。至此,你已经成功在Colab安装了Anaconda。 需要注意的是,Colab是一种云端环境,所以Anaconda的安装是临时的,当你关闭或重新加载笔记本时,安装的内容将会丢失。如果你在Colab上需要长期使用Anaconda,建议将其安装到云端存储,例如Google Drive中,并在每次使用时重新安装。 ### 回答2: 在Colab安装Anaconda可以通过以下步骤完成。首先,打开Colab并创建一个新的notebook。然后,点击notebook顶部的"+代码"按钮,在新的代码单元格中输入以下命令并运行: ``` !wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh ``` 该命令将下载一个Anaconda安装脚本。下载完成后,运行以下命令以安装Anaconda: ``` !bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh ``` 这将启动Anaconda的安装程序。在安装过程中,您将被询问是否同意许可协议、安装位置等选项。按照提示进行操作即可。 安装完成后,可以通过以下命令来验证Anaconda是否成功安装: ``` !conda --version ``` 如果命令输出了Anaconda的版本号,则表示安装成功。 接下来,我们需要将Anaconda添加到Colab环境变量中。在新的代码单元格中输入以下命令并运行: ``` import sys sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages') ``` 这将把Anaconda的库路径添加到Colab中。 最后,可以通过以下命令来验证Anaconda库是否成功添加到Colab中: ``` import pandas as pd import numpy as np ``` 如果以上命令没有报错,则表示Anaconda已成功添加到Colab中。 总之,在Colab安装Anaconda需要下载安装脚本、运行脚本进行安装,并将Anaconda添加到Colab环境变量中。完成这些步骤后,您可以在Colab中使用Anaconda提供的强大功能和库。 ### 回答3: Colab并没有提供直接通过Colab平台安装Anaconda的选项。然而,我们可以通过执行一系列命令来在Colab安装Anaconda。 下面是在Colab安装Anaconda的步骤: 1. 首先,我们需要安装Miniconda,它是Anaconda的轻量级版本。我们可以使用以下命令下载并安装Miniconda: ``` !wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh !chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh !bash ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -bfp /usr/local ``` 2. 接下来,我们需要设置环境变量,以便Colab可以正确地找到Miniconda安装目录。运行以下命令: ``` import sys sys.path.append('/usr/local/lib/python3.7/site-packages/') ``` 3. 然后,我们可以使用以下命令检查Miniconda是否已成功安装: ``` !conda --version ``` 4. 最后,我们可以使用以下命令来安装我们想要的任何包或环境: ``` !conda install package_name ``` 在这个命令中,package_name是我们想要安装的包的名称。 总结起来,要在Colab安装Anaconda,我们需要先安装Miniconda,然后设置环境变量,最后通过conda命令安装必要的包或环境。请记住,Colab是一个云端Jupyter笔记本平台,我们只能在当前会话中进行Anaconda的安装,重启后会失效。
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