如何根据空间群产生对称的分子

利用pdb中的空间群和ccp4中的pdbset。
一：
pdbset中有个选项symgen，可以实现该操作，例如：
pdbset xyzin 1904_home_refine_5.pdb xyzout temp.pdb <<eof
cell 50.105   63.885   96.909  90.00  90.00  90.00
symgen P212121
eof
二：如果要求计算平移对称性，同样可以使用pdbset，如分别根据不同轴进行平移
pdbset xyzin "$outdir/first.pdb" xyzout "$outdir/xtran.pdb" <<eof
shift $tx 0 0
eof
pdbset xyzin "$outdir/first.pdb" xyzout "$outdir/ytran.pdb" <<eof
shift 0 $ty 0
eof
pdbset xyzin "$outdir/first.pdb" xyzout "$outdir/ztran.pdb" <<eof
shift 0 0 $tz
eof