[LeetCode]Repeated DNA Sequences

题目描述：

All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.

Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.

For example,

Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT",

Return:
["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"].

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  Hash Table Bit Manipulation

 解题思路：本题目中，最初采用的方法很简单，就是顺序取子串，存入hashmap中，如果已经存在说明超过两个，保存结果，否则，继续。但是使用这种方法得到的结果提交后出现，超时错误。其中，题目中提示采用位操作的形式，而此题目中只包含了A,C,G,T这四个字母，对应的值 分别为 65, 67, 71, 84，二进制表示为 1000001, 1000011, 1000111, 1010100，因此，我们可以只用后三位就可以表示这四个字母了，而且为了满足十个字符存储到一个里面，则需要int的30个位来存储即可，这样就可以大大的降低存储空间了，实现如下:

public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
         List<String> result=new ArrayList<String>();
        Map<Integer,Integer> r=new HashMap<Integer,Integer>();
        int key=0;
        for(int i=0;i<s.length();i++){
        	
        	key=(key<<3|s.charAt(i)&0x7)&0x3fffffff;
        	if(r.containsKey(key)){
        		int k=r.get(key);
        		k++;
        		r.put(key, k);
        		if(k==2)result.add(s.substring(i-9,i+1));
        	}
        	else{
        		r.put(key, 1);
        	}
        }
        return result;
    }