分布式 [ mpi 安装与执行]

最新推荐文章于 2024-06-06 13:17:43 发布

jesseshen

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分类专栏：项目必需文章标签： networking makefile 服务器 ssh 测试 testing

本文链接：https://blog.csdn.net/jesseshen/article/details/6652815

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本文档详细介绍了如何在分布式环境中安装MPI（Message Passing Interface），包括从官方网站下载MPICH，并指导如何配置和执行MPI程序，适合服务器管理和网络测试人员参考。

摘要由CSDN通过智能技术生成

2.创建NFS服务
sudo apt-get install nfs-common nfs-kernel-server
在服务器节点/home目录下建立mpi目录，并将其设置成NFS服务器，在/etc/exports
文件中加入一行：
/home/mpi node1(rw) node2(rw)
在客户端节点的/etc/fstab文件中增加一行：
node1:/home/mpi /home/mpi nfs rw,bg,soft 0 0
将/home/mpi这个目录从服务器节点输出，并装载在各客户端的/home/mpi目录下，从而便于在各节点间分
发任务.

3.修改/etc/hosts文件，将所有节点名称极其ip地址填入。例如：
127.0.0.1　localhost.localdomain localhost
219.242.255.161　node1
219.242.255.162　node2
......................
每个节点都进行类似的设置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1 ... noden的名
称相互访问。你能通过ping noden 或 ssh noden进行测试。

4.安装设置ssh
sudo apt-get install openssh-client openssh-server
以设定的用于启动mpi计算的用户登录，运行
ssh-keygen -t rsa    #对于所有提示直接回车即可
这将生成一个密钥对，分别存放在~/.ssh/id_rsa和~/.ssh/id_rsa.pub文件内。
然后进行访问授权，运行：
cp ~/.ssh/id_rsa.pub ~/.ssh/authorized_keys
chmod go-rwx ~/.ssh/authorized_keys
ssh-agent $SHELL
ssh-add
在每个节点重复一遍。收集所有节点下的authorized_keys文件，合并为一个authorized_keys，然后再分发到每个节点的$HOME/.ssh目录下去。
试着在某一节点上登录所有节点（包含自身），ssh noden，则在$HOME/.ssh/下生成一个名为known_hosts的文件，里面放着访问该主机的身份指纹，也在各个节点上将known_hosts文件作同样的拷贝。
以上的目的是使各节点相互之间访问无需输入密码。
5.开启各项必需的服务
ssh
nfsd
networking
6.在各节点编译、安装mpich2.(详情参考安装文件)
./configure --prefix=/usr/local
make
make install
7.设置
在$HOME目录下执行
   touch ~/.mpd.conf
在里面输入
   secretword= #为任意你所想填写的字符串，如"mysecret"
再执行
   chmod 600 ~/.mpd.conf
编写一个mpd.hosts文件，内容如下：
   node1 #集群中各节点名,一行一个
   node2
   ......

8.测试安装是否正确
   mpdboot -n number -f mpd.hosts #number为要启动的节点数，mpd.hosts为包含机器名的文件
   mpdtrace                        #查看已启动的节点
   mpdallexit                      #所有节点退出

拷贝/usr/local/share/examples_graphics下的用例到其他目录，编译cpi.c:
   mpicc -o cpi cpi.c
再执行：
   mpdboot -n 2 -f mpd.hosts
   mpiexec -n 2 cpi
将会获得如下信息
   Process 0 on node1
   Process 1 on node2
   ..................
单机上模拟多节点能用如下方式：
   mpd&   #启动mpi任务管理服务,只启动本节点的mpd
   mpiexec -n 2 cpi
如果都能正常运行即证实集群环境安装成功。

1. 下载，网址：http://www.mcs.anl.org/mpi/mpich

2. 将软件包解压
tar zxvf mpich.tar.gz
tar xvf mpich.tar
3. 进入解开的mpich子目录
cd mpich
4. 创建Makefile和编译
./configure [-prefix=/usr/local/mpich-1.2.1]
make
5. 测试安装是否正确
cd examples/basic
make cpi
../../bin/mpirun -np 4 cpi
$(HOME)/mpich/ make testing
6. 将mpich安装到指定的目录
make install