MPI集群环境搭建

本文详细介绍了在Ubuntu14.04环境下搭建MPI集群的过程,包括选择Linux版本、安装MPICH、实现SSH免密登录、建立和挂载NFS共享目录,以及在集群环境中执行MPI程序的步骤。通过这些步骤,确保了多个节点之间的并行计算能力。
摘要由CSDN通过智能技术生成

我在前面两篇博客中简要介绍了为什么要并行计算以及MPI的一些学习心得,接下来我们正式开始MPI的学习之路。我们知道MPI是分布式内存编程,所以这篇博客会详细讲解MPI集群环境的搭建过程。

一、准备工作

  1. 选择Linux版本:这里我选择的是Ubuntu14.04,其他Linux版本如CentOS、Fedora等操作类似,一些命令和配置文件路径会有一些差别。
  2. 物理服务器集群和虚拟节点选择:我是用VMware创建多个虚拟机来进行集群模拟,后期我会把环境部署到实验室的服务器集群上,基本操作应该是一样的,如果有需要注意的地方,我会在后续的博客中进行说明。
  3. 在VMware中安装Ubuntu14.04,实验模拟安装两个节点即可。建议初始设置时用户名取一样的,因为后面每个虚拟机节点之间免密登录时需要保证用户名一致,这样可以避免出现未知的问题。

二、安装MPICH

到MPICH官网下载源码包,解压、配置、编译、安装即可。
我的安装文件
上图是我VMware的一些文件夹的命名,受电脑配置限制,我创建了两个节点,如图左边所示,节点名称是node1和node2。我将mpich-3.2.tar.gz压缩包放在了mpi_install路径下,mpi_share是节点之间的共享目录,后面会说明。
首先,解压mpich-3.2.tar.gz:tar -zxvf ./mpich-3.2.tar.gz。
解压后的文件夹中有个README文件,打开后有详细的安装步骤,这里我简要说明:

  • 为避免错误,在安装MPICH之前,分别执行以下命令:sudo apt-get update(保证安装的源最新)、sudo apt-get install gcc(安装gcc编译器,用于编译C语言)、sudo apt-get install g++(安装g++编译器,用于编译C++)、sudo apt-get install gfortran(安装gfortran编译器,用于编译fortran语言)。
  • 进入源码包解压后的路径,执行如下命令:cat /etc/shells
    (1)如果显示为:/bin/sh 和 /bin/bash,则配置、编译和
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