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RSS订阅原创 串联fasta文件中的序列，去除ATG、TAA
和 Shell 脚本位于同一目录，并正确设置文件路径和权限。目的：根据提供的模式修改序列 ID 并修剪特定碱基。
2024-07-23 19:04:01
189
原创 批量更改fasta文件名为序列ID名
提取第一个序列ID（假设ID在'>'符号之后，以空格或换行结束）# 检查new_id是否为空，以防止空ID的情况。# 循环遍历当前目录下所有的 .fasta 文件。# 去除可能的路径分隔符。实现重命名目录中所有。
2024-07-23 16:58:14
488
原创 重新命名id使两个FASTA文件中的ID名称保持一致
print(f"读取文件 {input_fasta_1} 时发生错误: {e}")print(f"读取文件 {input_fasta_2} 时发生错误: {e}")print(f"写入文件 {output_fasta} 时发生错误: {e}")print(f"错误：找不到文件 {input_fasta_1}")print(f"错误：找不到文件 {input_fasta_2}")# 将修改后的序列写入新的fasta文件。# 读取第一个fasta文件的序列ID。# 重命名第二个fasta文件中的序列ID。
2024-07-23 11:52:18
407
原创 Fasta文件批量更改ID名（正则表达式）
replacement = r"new_part\1" # 修改此处以适应你的实际替换。pattern = r"old_part(\d+)" # 修改此处以适应你的实际模式。# 写入修改后的记录。# 设定目录、匹配模式和替换字符串。
2024-07-22 11:29:23
359
空空如也
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