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RSS订阅原创 python实现fasta格式转换为phy格式
os.chdir(r"/path/to/working/directory") # 将路径替换为工作目录路径。fasta_file = "input.fasta" # 输入的FASTA文件名。phy_file = "output.phy" # 输出的PHYLIP文件名。
2023-04-19 14:54:34
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原创 python实现基因表达量FPKM值转化TPM值
加载包含FPKM值的DataFrame，假设列名为 "id"、"S3"、"S4"、"S5"、"S6"、"S7"、"S8"，分隔符为制表符，运行时根据自己FPKM文件的列名和列数进行修改。# 设置工作目录 输入文件在此目录下，输出文件也会在此目录下输出。# 将转换后的数据输出到tpm.csv文件，使用制表符作为分隔符。# 计算每个样本的FPKM之和。# 计算每个基因的TPM值。# 删除原始的FPKM列。
2023-04-19 14:36:04
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空空如也
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