Principles of fMRI 1 课程笔记
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<Principles of fMRI 1>课程笔记1--fMRI简介以及数据分析
现代的神经影像学技术有这样几种::脑电图(EEG), 单光子发射体层成像(SPECT), 正电子发射型计算机断层显像(PET), 功能性磁共振成像(fMRI),侵入性光学成像(invasive optical imaging),颅内电极记录(intracranial recording) , 脑皮层电图(ECoG),其中最为广泛应用的是fMRI和PETPET: 测量血流量和神经系统里的化学物质转载 2016-12-24 19:17:02 · 57532 阅读 · 0 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记3--MRI的原理
1. MR物理基础:核磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)是一种多功能的成像方式,既可以用来研究大脑结构,也可以用来研究大脑的功能。我们可以通过不同的大脑图像来强调不同组织特性的对比(即可以分辨不同的大脑组织),而这些图像都是用MR scanner来获取的。简单来说,MR scanner就是一个带有很强的磁场(1.5-7.0 Tesla)的电磁体。转载 2017-01-02 20:20:00 · 53051 阅读 · 0 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记5--理解信号、噪音与血流
MRI扫的是大脑的结构图像,也叫T1权重图像。它有着很高的空间分辨率,可以从中看到非常清晰的解剖结构,也可以从中区分出各种不同的组织。 fMRI往往用于研究大脑的具体功能,扫出来的是功能图像,也叫做T2*权重图像。虽然它的空间分辨率比较低,但是时间分辨率很高,可以在很短的时间内扫出一叠功能图像。这样子就可以研究实验操作究竟是如何影响大脑的MRI信号的。 一个fMRI实验相当于包含了一个MRI图像转载 2017-01-06 08:53:30 · 52147 阅读 · 0 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记6--fMRI的噪音来源
BOLD fMRI包含多种来源的噪音,与设备本身和被试本身相关噪音的来源-系统内自由电子的热运动-磁场和其梯度的不稳定性-头动及其对磁场的交互影响-生理影响:心跳、呼吸,co2浓度这些噪声如何在数据内出现-高频的spikes-图像的伪影和畸变-低频的漂移和周期性的波动如何减少噪音和伪影的影响在获取过程中:-我们需要高质量的控制以确保扫描器本身工作很正常-合理安排实验的序列-我们还可以用一些特殊的序列转载 2017-01-07 11:18:31 · 50820 阅读 · 3 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记7--fMRI数据的时间分辨率和空间分辨率
从图中可以发现,MEG和EEG有着极好的时间分辨率,但空间分辨率很差,因此在MEG和EEG研究中,常常不知道信号到底来自于哪个脑区。而PET成像技术的时间分辨率一般是几分钟,略差于BOLD fMRI,而空间分辨率是厘米级的,略优于EEG和MEG。在fMRI技术中,ALS fMRI(arterial spin labeling fMRI,动脉自旋标记fMRI)在时间稳定性方面非常好,即它可以比较间隔时转载 2017-01-08 12:28:26 · 59808 阅读 · 0 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记8--fMRI的数据预处理
刚采集的原始图像数据会经过一系列的预处理步骤。这些步骤主要是分辨并去除伪影(Artifact),或者是检验一些模型所需的假设是否成立。具体来说,有三个目的:尽量减少因为数据采集(Data acquisition)和生理学特性(Physiological)导致的误差我们想检验一下模型的统计假设,并且尽可能的做一些变换让数据符合这些假设将不同个体的数据的脑区位置标准化(Standardize th转载 2017-01-09 09:38:39 · 66697 阅读 · 8 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记4--图像K空间理解
K空间的数据分布实际上是图像空间中数据的二维傅立叶变换结果。 K空间中的数据点和图像空间中的数据点并不是一一对应的。一个K空间中的数据点对应了图像空间中所有数据点的一部分信息。事实上,K空间中的数据正是图像空间中的数据作二维傅立叶变换的结果(图1),也就是说,我们的“大脑图像”可以被看作是由一系列频率、相位、方向各异的二维正弦波叠加而成的,而K空间的数据正表示了图像的正弦波组成。因此,为了理解如何转载 2017-01-04 18:25:30 · 55534 阅读 · 2 评论 -
<Principles of fMRI 1>课程笔记2--fMRI数据结构
一、 时间分辨率与空间分布率、结构图像与功能图像时间分辨率(temporal resolution):时间分辨率由扫描一张图片所需的时间决定,事实上扫描一张图片的时间是由一个扫描时的参数TR决定的。他决定了我们区分观察不同时间点上大脑变化的能力。空间分辨率(spacial resolution):空间分辨率决定了我们区分不同区域微小变化的能力(图片是否清晰)。在磁场等条件一样时,fMRI扫描出的图像转载 2017-01-01 22:49:58 · 51384 阅读 · 1 评论