批量下载获取NCBI SRA的公共数据(raw reads/assembly等)
收集好需要下载的raw reads/assembly的accession number号,以及accession number对应的Bioproject号。下载过程中可能某些文件会下载中断/失败,完成一次下载后,可以将下载成功的注释掉(标#),再将脚本运行一遍,反复几次绝大多数即可成功。选择需要下载的Accession,并add to collection,然后点击“购物车”,进入已选择的信息中。注:需要在Linux服务器或者Windows本地部署好Aspera软件,并可成功运行ascp命令。
原创
2024-07-30 10:33:06 ·
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