Vaa3d中神经元重建结果颜色对照图

最新推荐文章于 2022-03-02 16:10:02 发布
最新推荐文章于 2022-03-02 16:10:02 发布
阅读量1.1k 收藏
点赞数
分类专栏： Vaa3d neuron tracing Reconstruction 文章标签： Vaa3d neuron tracing 颜色
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/jujiyu6446/article/details/85279601
版权

Vaa3d中神经元重建结果颜色由SWC文件中的type列控制

0白色
1黑色
2红色
3蓝色
6黄色
7绿色
20-275用于matlab热力图

下图Vaa3d重建颜色渲染对照图，最左边的白色为type值为0。
Vaa3d重建结果颜色渲染对照表
Vaa3d颜色渲染对照表
在v3d_external\v3d_main\3drenderer中的renderer_obj.cpp文件中，
neuron_type_color
{255, 255, 255}, // white, 0-undefined
{20, 20, 20 }, // black, 1-soma
{200, 20, 0 }, // red, 2-axon
{0, 20, 200}, // blue, 3-dendrite
{200, 0, 200}, // purple, 4-apical dendrite
//the following is Hanchuan’s extended color. 090331
{0, 200, 200}, // cyan, 5
{220, 200, 0 }, // yellow, 6
{0, 200, 20 }, // green, 7
{188, 94, 37 }, // coffee, 8
{180, 200, 120}, // asparagus, 9
{250, 100, 120}, // salmon, 10
{120, 200, 200}, // ice, 11
{100, 120, 200}, // orchid, 12
//the following is Hanchuan’s further extended color. 111003
{255, 128, 168}, // 13
{128, 255, 168}, // 14
{128, 168, 255}, // 15
{168, 255, 128}, // 16
{255, 168, 128}, // 17
{168, 128, 255}, // 18
{0, 0, 0}, //19 //totally black. PHC, 2012-02-15
//the following (20-275) is used for matlab heat map. 120209 by WYN
{0,0,131}, //20

远野贵树97
关注
专栏目录
ganymed-ssh2-build210-sources.jar.zip
06-21
下载网站https://repo1.maven.org/maven2/ch/ethz/ganymed/ganymed-ssh2/build210/ 此jar源码文件中包含以下这些类： SCPClient.lass Session.class Connection.clss 等许多文件传输类。 查看源码的方法： 1.把此jar文件夹在加载到eclipse中（鼠标右键build path - configure build path-libraries-add jars-选择此jar文件(本地路径)-ok-apply） 2.在代码中，把鼠标光标放在要查看源码的类名称上，按住键盘Ctrl键，当光标变成小手时，点击鼠标左键。当出现一个页面时，点击外部文件路径，选择此jar文件的路径。
Ganymed SSH-2 for Java
步行者的专栏
12-02 5697
在java程序中执行shell命令的时候，比较常用的是Ganymed（http://www.cleondris.ch/opensource/ssh2/）的包。 有了这个功能后我们就可以实现在网页上面操作一堆命令的工作了。直接去网站下载最新版本。服务器必须是SSH servers。官方介绍如下： Ganymed SSH-2 for Java is an open source library
ganymed ssh-2 for java_Ganymed SSH-2 for Java
weixin_35179649的博客
02-25 398
Ganymed SSH-2 for Java是一个纯Java实现的SHH2库，官网为http://www.ganymed.ethz.ch/ssh2/，最新的更新时间为2006年10月，在用之前，请仔细看一下FAQ，真的能避免很多很多问题，下面列出几条重要的：一，如果使用Session.execCommand()方法，则每个session中只能执行一条命令import java.io.Buffere...
ganymed-ssh2-262.jar
09-02
Ganymed SSH2是一个开源的Java实现，它允许开发者在Java程序中集成SSH功能，从而能够通过SSH协议与远程系统进行交互。 描述中提到的“使用 ganymed-ssh2-262.jar 通过ssh协议链接资源执行脚本命令”表明了这个库的...
ganymed-ssh2 工具类
03-06
ganymed-ssh2是一个开源Java库，它提供了对SSH2协议的全面支持，使得开发人员能够在Java应用程序中轻松地进行远程操作，如执行命令、传输文件等。本文将深入探讨ganymed-ssh2工具类的使用及其核心功能。 ** SSH连接...
ganymed-ssh2-build250.rar，jar包，源码，例子，javadoc
12-10
Ganymed SSH2是一个开源的Java库，用于实现Secure Shell (SSH2)协议，允许Java应用程序进行安全的远程登录、文件传输以及各种安全网络服务。这个库的名字来源于希腊神话中的 Ganymede，他是宙斯的使者，象征着远程...
ganymed-ssh2-build
11-07
Ganymed SSH2是一个由Christian Plattner开发的Java实现，它允许Java程序以客户端模式连接到支持SSH2的服务器，执行各种操作。 标签“ssh2 ganymed”进一步确认了这个库与SSH2协议以及Ganymed项目的关系。Ganymed ...
ganymed-ssh2-263.jar
01-21
解决openssh升级到8.2以后无法登录的问题，支持jdk1.5及以上版本
ganymed-ssh2-build210.jar
08-17
该资源包含java操作linux命令的jar包和操作linux命令的文档。 利用该java包可以远程操作linux命令 可以上传 下载 打印linux的命令
ganymed-ssh2-build210.jar java远程访问linux服务器操作、上传下载文件
12-08
java远程访问linux服务器操作 远程执行shll脚本或者命令、上传下载文件 package com.szkingdom.kfit.bank.ccbDirectShortcut.helper; import ch.ethz.ssh2.Connection; import ch.ethz.ssh2.SCPClient; import ch.ethz.ssh2.Session; import ch.ethz.ssh2.StreamGobbler; import common.Logger; import org.apache.commons.lang.StringUtils; import java.io.*; import java.util.logging.Level; /** * SCP远程访问Linux服务器读取文件 * User: boyer * Date: 17-12-7 * Time: 下午3:22 * To change this template use File | Settings | File Templates. */ public class ScpClient { //字符编码默认是utf-8 private static String DEFAULTCHART="UTF-8"; protected static org.apache.log4j.Logger log = org.apache.log4j.Logger.getLogger(ScpClient.class); static private ScpClient instance; private Connection conn; static synchronized public ScpClient getInstance(String IP, int port, String username, String passward) { if (instance == null) { instance = new ScpClient(IP, port, username, passward); } return instance; } public ScpClient(String IP, int port, String username, String passward) { this.ip = IP; this.port = port; this.username = username; this.password = passward; } private String ip; private int port; private String username; private String password; public String getUsername() { return username; } public void setUsername(String username) { this.username = username; } public String getPassword() { return password; } public void setPassword(String password) { this.password = password; } public int getPort() { return port; } public void setPort(int port) { this.port = port; } /** * 远程登录linux的主机 * @author Ickes * @since V0.1 * @return * 登录成功返回true，否则返回false */ public Boolean login(){ boolean flg=false; try { conn = new Connection(ip); conn.connect();//连接 flg=conn.authenticateWithPassword(username, password);//认证 } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return flg; } /** * 下载文件 * @param remoteFile 远程文件地址 * @param localTargetDirectory 本地目录地址 */ public void getFile(String remoteFile, String localTargetDirectory) { try { if(login()){ SCPClient client = new SCPClient(conn); client.get(remoteFile, localTargetDirectory); conn.close(); } } catch (IOException ex) { log.error(ex); } } /** * 上传文件 * @param localFile 本地目录地址 * @param remoteTargetDirectory 远程目录地址 */ public void putFile(String localFile, String remoteTargetDirectory) { try { if(login()){ SCPClient client = new SCPClient(conn); client.put(localFile, remoteTargetDirectory); conn.close(); } } catch (IOException ex) { log.error(ex); } } /** * 上传文件 * @param localFile 本地目录地址 * @param remoteFileName 重命名 * @param remoteTargetDirectory 远程目录地址 * @param mode 默认0600权限 rw 读写 */ public void putFile(String localFile, String remoteFileName,String remoteTargetDirectory,String mode) { try { if(login()){ SCPClient client = new SCPClient(conn); if((mode == null) || (mode.length() == 0)){ mode = "0600"; } client.put(localFile, remoteFileName, remoteTargetDirectory, mode); //重命名 ch.ethz.ssh2.Session sess = conn.openSession(); String tmpPathName = remoteTargetDirectory +File.separator+ remoteFileName; String newPathName = tmpPathName.substring(0, tmpPathName.lastIndexOf(".")); sess.execCommand("mv " + remoteFileName + " " + newPathName);//重命名回来 conn.close(); } } catch (IOException ex) { log.error(ex); } } public static byte[] getBytes(String filePath) { byte[] buffer = null; try { File file = new File(filePath); FileInputStream fis = new FileInputStream(file); ByteArrayOutputStream byteArray = new ByteArrayOutputStream(1024*1024); byte[] b = new byte[1024*1024]; int i; while ((i = fis.read(b)) != -1) { byteArray.write(b, 0, i); } fis.close(); byteArray.close(); buffer = byteArray.toByteArray(); } catch (FileNotFoundException e) { e.printStackTrace(); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return buffer; } /** * @author Ickes * 远程执行shll脚本或者命令 * @param cmd * 即将执行的命令 * @return * 命令执行完后返回的结果值 * @since V0.1 */ public String execute(String cmd){ String result=""; try { if(login()){ Session session= conn.openSession();//打开一个会话 session.execCommand(cmd);//执行命令 result=processStdout(session.getStdout(),DEFAULTCHART); //如果为得到标准输出为空，说明脚本执行出错了 if(StringUtils.isBlank(result)){ result=processStdout(session.getStderr(),DEFAULTCHART); } conn.close(); session.close(); } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return result; } /** * @author Ickes * 远程执行shll脚本或者命令 * @param cmd * 即将执行的命令 * @return * 命令执行成功后返回的结果值，如果命令执行失败，返回空字符串，不是null * @since V0.1 */ public String executeSuccess(String cmd){ String result=""; try { if(login()){ Session session= conn.openSession();//打开一个会话 session.execCommand(cmd);//执行命令 result=processStdout(session.getStdout(),DEFAULTCHART); conn.close(); session.close(); } } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return result; } /** * 解析脚本执行返回的结果集 * @author Ickes * @param in 输入流对象 * @param charset 编码 * @since V0.1 * @return * 以纯文本的格式返回 */ private String processStdout(InputStream in, String charset){ InputStream stdout = new StreamGobbler(in); StringBuffer buffer = new StringBuffer();; try { BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(stdout,charset)); String line=null; while((line=br.readLine()) != null){ buffer.append(line+"\n"); } } catch (UnsupportedEncodingException e) { e.printStackTrace(); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } return buffer.toString(); } }
java实现ssh方式连接linux（包含ganymed-ssh2-build210.jar包）
05-05
java实现ssh方式连接linux（包含ganymed-ssh2-build210.jar包） ---------Java语言+绚丽的界面+仿ssh实现调用Linux的Terminal，实现远程连接linux进行命令行的操作！
ssh协议依赖jar包：ganymed-ssh2-build
05-22
ganymed-ssh2-build ssh2 ch.ethz.ssh2.Connection ch.ethz.ssh2.SCPClient
SSH客户端开发开源组件Ganymed SSH-2 for Java初体验
医疗影像检索
05-26 3142
1、Ganymed SSH-2 for Java Ganymed SSH-2 for Java是一个纯Java实现的SHH2库。 看官方介绍： Ganymed SSH-2 for Java is a library which implements the SSH-2 protocol in pure Java (tested on J2SE 1.4.2 and 5.0). It all
java 服务器文件下载
u013015301的博客
03-02 2833
1.环境 引入的包：ganymed-ssh2-build210.jar 包的下载地址：http://www.ganymed.ethz.ch/ssh2/ 2.创建文件下载类：FileLoadUtil 代码如下 package com.broadway.hhMtLoad.utils; import java.io.File; import java.io.IOException; import java.io.UnsupportedEncodingException; import ch.ethz.ssh2
ganymed-ssh2-build210.jar 操作linux
最新发布
09-09
ganymed-ssh2-build210.jar 是一个Java库，用于通过SSH协议连接和远程操作Linux系统。它提供了一组功能丰富的API，使得在Java程序中可以轻松地实现与Linux系统的通信和操作。 使用ganymed-ssh2-build210.jar，我们...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值