Vaa3D 神经元可视化辅助分析软件界面基本介绍

一、打开图片

  1. 启动Vaa3D神经元可视化辅助分析软件;
  2. 通过File—Open-Image(快捷键Ctrl + O)读取三维神经元图片。

二、主界面操作

  1. 图片打开后进入截面三视图主界面;
  2. 主界面左上角为截面三视图,各个截面可通过鼠标滚轮更改聚焦位置;
  3. 主界面右侧为Options区域,主要功能有Focus Coordinates(聚焦点)、Zoom(缩放)、Channels(通道)、Landmark Controls(标记点控制)、See in 3D(三维视图模式);
  4. 主界面下方为Information of your selections文本框,文本框内显示图片的基本信息、当前聚焦点、Marker点信息等。

三、3D 界面操作

  1. 在主界面点击“See in 3D”选项、或通过标题栏Visualize—3D Viewer for entire image(快捷键Ctrl + V)进入三维视图模式。
  2. 3D界面可通过按住鼠标左键旋转图像,通过鼠标右键选择功能,通过滚轮缩放图像;
  3. 3D界面右侧为Controls区域,主要功能有图像及内容选项、XYZ三轴cut选项、旋转缩放选项以及“See in VR”等。

四、TeraFly的基本操作

  1. 通过标题栏—Advanced—Big-Image-Data—TeraFly进入TeraFly模式;
  2. 在TeraFly控制界面中,通过File—Open-TeraFly-Image,选择TeraFly文件夹;
  3. 通过鼠标滚轮、Zoom选项和TeraFly控制界面—Viewer—Resolution控制和选择分辨率。

五、插件

插件将通过标题栏—Plug-In打开。

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