Slicer学习笔记（二十四）volume获取vtkOrientedImageData 数据

最新推荐文章于 2024-03-02 22:36:30 发布
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分类专栏： slicer 文章标签： slicer
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本文介绍了如何在Slicer中从volume获取vtkImageData和vtkOrientedImageData，主要关注如何通过CreateOrientedImageDataFromVolumeNode函数转换volume数据。
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Slicer学习笔记（四十九）slicer vtkOrientedImageDataResample
juluwangriyue的博客
02-09 342
Slicer学习笔记（四十九）slicer vtkOrientedImageDataResamplevtkOrientedImageDataResample vtkOrientedImageDataResample 文件路径 slicersources-src\Libs\vtkSegmentationCore\vtkOrientedImageDataResample.cxx //-----------------------------------------------------------------
Slicer学习笔记（四十八）slicer vtkOrientedImageData
juluwangriyue的博客
01-30 770
Slicer学习笔记（四十八）slicer vtkOrientedImageData1、方向信息的重要性1.1、动机 Motivation1.2、设计 Design1.3、路线图 RoadmapPhase 1. Algorithm feasibility - DONEPhase 2. Design feasibility - WIP2、vtkOrientedImageData 1、方向信息的重要性 Documentation/Labs/VTK-Orientation 1.1、动机 Motivation In
VTK学习笔记（四十）vtk提取单层数据
juluwangriyue的博客
02-20 789
VTK实现单层图片的提取方法有很多，可以使用的filter有很多。提取中心层片 y轴切片。提取中心层片，z轴切片。提取中心层片，x轴切片。
总结：K8S之之Volume存储数据
w2009211777的专栏
04-13 221
一、介绍 我们知道，一个运行中的容器，默认情况下，对文件系统的写入，都是发生在其分层文件系统的可写层的，一旦容器运行结束，...
Slicer学习笔记（四十）slicer从volume生成labelmap并显示
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01-18 929
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Slicer学习笔记（六十五） 3DSlicer的医学图像数据增强扩展模块
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03-02 701
基于3D Slicer5.1.0 编写了一个测试医学图像的数据增强测试扩展模块。扩展模块名：DataAugementation下载该项目后，可以将该扩展模块添加到3D Slicer的扩展中。关于如何给3DSlicer 添加扩展可以看我前面的博客。
Slicer学习笔记（三十四）slicer增加节点与获取节点
juluwangriyue的博客
12-31 471
Slicer学习笔记（三十四）slicer增加节点与获取节点1、在slicer的Data模块中查看数据2、打开Data模块的“Show MRML ID's”3、获取节点4、增加节点5、获取节点汇总 1、在slicer的Data模块中查看数据 2、打开Data模块的“Show MRML ID’s” 3、获取节点 获取节点有2种方式，分别是通过节点名和通过ID 通过节点名获取节点： vtkMRMLScalarVolumeNode* volumeNode; 通过ID获取节点： 在这里插入代码片 4、增加
3D Slicer Volume Rendering模块使用简单说明
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12-28 1408
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vtk中提取体中的某一规则矩形体区域
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05-03 1634
1.vtkExtractVOI /** * @brief 提取体中感兴趣的某一区域块 vtkSmartPointer<vtkExtractVOI> extractVOI = vtkSmartPointer<vtkExtractVOI>::New(); extractVOI->SetInputConnec
Volume数据存储详解
Yosigo_的博客
08-12 2301
数据存储 在前面已经提到，容器的生命周期可能很短，会被频繁地创建和销毁。那么容器在销毁时，保存在容器中的数据也会被清除。这种结果对用户来说，在某些情况下是不乐意看到的。为了持久化保存容器的数据，kubernetes引入了Volume的概念。 Volume是Pod中能够被多个容器访问的共享目录，它被定义在Pod上，然后被一个Pod里的多个容器挂载到具体的文件目录下，kubernetes通过Volume实现同一个Pod中不同容器之间的数据共享以及数据的持久化存储。Volume的生命容器不与Pod中单个容器
Slicer中GetBinaryLabelmapRepresentation的理解
huihui__huihui的博客
08-28 128
无摘要
Slicer学习笔记（二十三）slicer调试自带模块
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Slicer学习笔记（二十三）slicer调试自带模块1、调试Segment Editor模块下的Grow from seeds2、调试文件与细节2.1、masterImageData的调试信息如下，可以确定该变量对应input_volume.2.2、masterImageExtent变量 关于slicer的调试设置请参考我的第二十篇博客：Slicer学习笔记（二十）slicer编写自己的扩展模块 1、调试Segment Editor模块下的Grow from seeds 这次笔记是调试 Segment E
VTK修炼之道14：图像处理_创建
沈春旭的博客
01-15 4614
1.引言:图像数据结构 数字图像文件内容由两个部分组成：图像头信息和数据。图像头信息定义了图像的基本信息，主要包括起点位置（Origin），像素间隔（space）和维数（dimension）。通过这三个参数即可以决定图像空间位置和规模。图像可以看做是空间中的一个规则网格，网格中的每个最小单元称之为一个像素（二维）或者体素（三维），这样网格在每个方向上的像素或者体素个数即为图像在该方向的维
VTK vtkImageData转vtkPolyData
WSG的博客--盛年不重来,一日难再晨.及时当勉励,岁月不待人.
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《itk实用demo》-Image 转化 vtkPolydata
就这样吧
09-13 1215
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Slicer学习笔记（三十七）slicer增加分割节点并显示
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01-12 1661
Slicer学习笔记（三十七）slicer增加分割节点并显示 分割结果显示到slicer的3D视图。 先将分割结果保存到vtkImageData，将vtkImageData转换成vtkO
VTK修炼之道13：数据读写_图像数据的读写
沈春旭的博客
01-15 6442
1.前言 VTK应用程序所需的数据可以通过两种途径获取: 第一种是生成模型 ;第二种是从外部存储介质里导入相关的数据文件,(如vtkBMPReader读取 BMP图像) 。VTK 也可以将程序中处理完成的数据写入单个文件中, 或者将所渲染的场景导出。从可视化管线的角度来看, 一般以数据的读取 (或由模型创建数据)开始,而以数据的写盘操作(或 Mapper)结束。 前面我们已经接触到了
VTK实现多个体数据映射到一起进行渲染
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02-20 3145
背景： 多个面数据（例如obj数据等）使用同一个Renderer通过增加多个Actor的方式是可以映射到一起的，但是如果透明度不是1的话深度层次会发生错乱。可以使用Renderer的UseDepthPeelingOn进行深度剥离，来使深度关系是正确的。 但是体数据通过这种方式是达不到深度关系正确的，类似于这种，是按照加入actor的顺序来排序的。 解决方案： 使用vtkMultiVolume来达到多个体数据在同一个空间映射的方案。 vt...
VTK笔记-从vtkImageData中获取子vtkImageData数据-感兴趣区提取-vtkExtractVOI类
黑山老妖的博客
07-20 1951
思路： 1.把所有得DICOM文件都读出信息来，每张DICOM对应一个<序号，z轴坐标>，然后按照z轴坐标排序，加载z轴坐标或者instance num在140-240范围内得dicom文件； 2.把所有dicom用vtk生产vtkImageData，然后从vtkImageData的标量中获取到140-240数据距离第一个像素的偏移量，然后拷贝出来； 参考资料 1.VTK修炼之道25：图像基本操作_图像子块提取（特征区域提取） ...
slicer学习笔记(十七)编写一个python扩展模块
04-30
Python是一门高级编程语言，它是一种动态类型、面向对象的语言，支持多种编程范式。Python在科学计算、数据分析、人工智能等领域有广泛的应用，越来越受到业界的关注。Python还有一个优点就是其灵活的扩展性，可以通过编写扩展模块来增强Python的功能。 编写一个Python扩展模块，需要先了解一下Python的C API，这是Python提供的一套C语言的API接口，可以用于编写Python扩展模块或者嵌入Python到其他应用程序中。扩展模块也可以用其他语言如C++、FORTRAN等编写，只要是遵循Python的C API规范即可。 编写Python扩展模块，可以使用Python自带的distutils模块来进行构建和安装。该模块可以用setup.py脚本来配置扩展模块的编译参数、依赖库等，并可以生成可执行文件或者扩展模块所需的动态链接库等文件。 下面是一个简单的Python扩展模块的例子，该模块可以计算两个数字的乘积： // test_module.c #include <Python.h> static PyObject* multiply(PyObject* self, PyObject* args) { int x, y; if (!PyArg_ParseTuple(args, "ii", &x, &y)) { return NULL; } return Py_BuildValue("i", x * y); } static PyMethodDef TestModuleMethods[] = { {"multiply", multiply, METH_VARARGS, "Returns the product of two integers."}, {NULL, NULL, 0, NULL} }; static struct PyModuleDef test_module = { PyModuleDef_HEAD_INIT, "test_module", "A test module that multiplies two integers", -1, TestModuleMethods }; PyMODINIT_FUNC PyInit_test_module(void) { return PyModule_Create(&test_module); } 在该模块中，我们定义了一个multiply函数，用于计算两个整数的乘积。该函数采用Python提供的PyArg_ParseTuple函数解析函数的输入参数，然后返回乘积。我们还定义了一个TestModuleMethods数组，它是一个PyMethodDef结构体的数组，里面记录了我们定义的函数的名称、函数指针、函数的参数类型等信息。最后我们使用PyModule_Create函数生成一个Python模块对象并返回。 我们需要将上面的代码保存到test_module.c文件中，并使用如下命令来构建并安装该模块： $ python setup.py build $ python setup.py install 在安装完成后，我们可以在Python解释器中使用该模块： >>> import test_module >>> test_module.multiply(10, 20) 200 编写Python扩展模块是一项有趣的工作，它可以让我们深入了解Python的内部机制，并且可以为我们解决一些实际问题带来便利。
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