探秘蓝藻生物钟蛋白KaiC的计时机制
生物钟的准确性与谐波特性
生物钟在生物体内起着至关重要的作用,它能让生物适应地球自转的精确周期。就像伽利略发现的摆的等时性被应用于机械钟的起搏器,使计时精度大幅提高一样,生物的生物钟也具有较高的准确性。一些生物的生物钟节律周期波动每天仅在几分钟到约10分钟之间。研究分析证实,KaiC磷酸化节律的周期也展现出类似的准确性。而生物钟的谐波特性对于实现这种准确性十分有利,因为谐波振荡的周期不受振幅变化的影响,且振荡能量守恒,这种物理运动几乎不受温度影响,这对于需要温度补偿的生物钟来说是非常理想的特性。
KaiC的ATP酶活性
KaiC是由519个氨基酸组成的蛋白质,其氨基酸序列与RecA等ATP酶相似。不过,KaiC的ATP酶活性极低,单个KaiC分子每天仅水解10 - 15个ATP,远低于许多酶的活性。KaiC有两个ATP酶结构域,N端的CI和C端的CII,它们通过铰链序列串联连接。
结构域 | 特点 |
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CI | 负责超过一半的总ATP酶活性,在周期确定中尤为重要,具有谐波振荡器的特性,可作为生物钟的起搏器 |
CII | 驱动磷酸化循环(KaiC自磷酸化和自去磷酸化),具有弛豫振荡器的特性,周期受温度影响 |
KaiC的ATP酶活性虽低,但在较宽的生理温度范围内稳定且具有温度补偿