Kun_98的博客

DRAM（Distilling and Refining Annotations of Metabolism，提取和精练代谢注释）是一种用于注释宏基因组组装基因组和VirSorter确定的病毒重叠群的工具。DRAM 使用KEGG、UniRef90、PFAM、dbCAN、RefSeq 病毒、VOGDB和MEROPS注释 MAG（metagenome assembled genomes，宏基因组组装基因组 ） ，也可使用病毒重叠群肽酶数据库以及自定义用户数据库。

CheckV 是一个完全自动化的命令行管道，用于评估单重叠群病毒基因组的质量，包括识别集成原病毒的宿主污染、估计基因组片段的完整性以及识别封闭基因组。

VirSorter2 应用多分类器从宏基因组中检测DNA 和 RNA 病毒

介绍一种无参考和无比对的机器学习方法 DeepVirFinder，用于使用深度学习识别宏基因组数据中的病毒序列。

kneaddata软件介绍，使用bowtie2去除人体DNA污染，并通过trimmomatic对序列进行筛选，最后fastqc报告序列质控结果