Distance-aware Molecule Graph Attention Network for Drug-Target Binding Affinity Prediction
药物和蛋白质(靶)之间有着结合亲和力,如果单独的把药物和蛋白质看做俩个独立的部分而忽略掉它们之间的相互作用以及3D坐标(矩阵S)的话是不合理的(如图b),因此本文提出将二者结合成为一个graph(图C),称为SPoG,其原子间距离矩阵为D(因为有各个原子的3D坐标S,因此可以转换成原子间的距离矩阵D,但是最主要用到的是距离embedding P),因此问题转化为通过结合图 以及原子距离举证标D来预测药物靶向结合亲和力(Drug-Target Binding Affinity)所提出的SpoG结构 .
原创
2022-03-29 17:47:10 ·
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