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转载 第二章 RNA-seq一般分析流程全套

提前申明:该贴参照于https://www.jianshu.com/p/e8cd62ba14fe标题1. 用conda安装RNA-seq所需要#启动conda自设环境conda activate python3 或者用source activate python3#安装所需软件(conda可以同时安装多个软件,但是建议初学者还是选择逐一安装,避免出现错误)conda inst...

2020-02-22 15:08:13 30938 1

翻译 第一章 初步学习生信分析过程中常见文件(fastq/bed/gtf/sam/bam/wig)的格式以及查看方式

测序数据FASTQ文件# zcat查看gzip压缩的文件# head -n 8 显示前8行文件内容(前8行代表2条序列)zcat filename.fq.gz | head -n 8 Q值得计算Illumina测序仪是按照荧光信号来判断所测序的碱基是哪一种的,例如红黄蓝绿分别对应ATCG,那么一旦出现一个紫色的信号该怎么判断呢,因此对每个结果都有一个概率的问题。起初sanger中...

2019-06-24 10:09:08 6290

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