DCM4CHE之OVERLAY层处理

概述

有些dicom文件中会有一层蒙版，主要是在主台拍摄完后对图像做的近一步说明，这一块信息也是存在dicom
tag中的，本文就来说明一下overlay层的解析和显示

前提

让我们先看看overlay是啥，见下图

蓝色箭头指向的就是overlay层显示的东西

overlay显示主要需要以下几个字段(其他还有帧数，起始位置等，遇到了再说)：

• (6000,0010) Overlay Rows
• (6000,0011) Overlay Columns
• (6000,0100) Overlay Bits Allocated

步骤

加载dicom文件
从dicom文件中取出overlay层的相关信息
将overlay层的像素信息绘制到图片上并保存到本地

具体实现

pom.xml:

	<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-core</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
		</dependency>

		<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-imageio</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
		</dependency>

		<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-imageio-opencv</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
			<scope>runtime</scope>
		</dependency>

java代码

	public void overlayProcess(String strPath) throws IOException {
		DicomInputStream in = new DicomInputStream(new File(strPath));
		Attributes attr = in.readDataset(-1, -1);
		if(attr == null) {
			return;
		}
		int nOverlayRows = attr.getInt(Tag.OverlayRows, 0);
		int nOverlayColumns = attr.getInt(Tag.OverlayColumns, 0);
		int nOverlayBitsAllocated = attr.getInt(Tag.OverlayBitsAllocated, 0);
		byte[] overlayData = attr.getBytes(Tag.OverlayData);
		System.out.println(nOverlayRows+" "+nOverlayColumns+" "+nOverlayBitsAllocated+" "+overlayData.length);
		
		BufferedImage BI = new BufferedImage(nOverlayColumns, nOverlayRows, BufferedImage.TYPE_4BYTE_ABGR);
		
		for(int i=0;i<overlayData.length;i++) {

			for(int k=0;k<8;k++) {
				int b = ((overlayData[i]>>k)&0x1);
				int value = 0;
				
				if(b > 0) {
					value = 0xff000000;
				}else {
					value = 0x00000000;
				}
				
				int rowIndwx = ((i*8)+k)/nOverlayColumns;
				int colIndwx = ((i*8)+k)%nOverlayColumns;
				BI.setRGB(colIndwx, rowIndwx, value);

			}
		}
		
		ImageIO.write(BI, "png", new File("D:/dicomFile/test/overlay.png"));
		System.out.println("end");
	}

main方法

	public static void main(String[] args) {
		try {
			process.overlayProcess("D:/dicomFile/test/overlay.dcm");
		} catch (IOException e) {
			// TODO Auto-generated catch block
			e.printStackTrace();
		}
	}

结果

注意：overlay层的图像一般是透明的，是和原始dicom图像叠加显示在一块的。