GraphPad prism处理cck-8获得ic50

C组为空白对照组,a组为dmso对照组,b组为细胞加药组,八个梯度的药物浓度

一、数据转化
首先,打开软件,选项中选择x的第一项,y'的第二项,单一药物浓度设定了几个孔就选几

把自己的药物浓度直接复制粘贴,x列为药物浓度的值

 选择【分析】→【变换、规范】中选择变换浓度(x),将x数值变换为以10为底的相应对数值

二、计算IC50
再次点击分析选项,选择【xy分析】中的“非线性回归(曲线拟合)”

前四个都很好,但我个人比较倾向于第一个:

 可以看到IC50值已经展现出来了

图像出来后由于我们进行了log可能会出现负值的情况,我们可以进行一定的调整,调整到自己想看到的样子。

### 关于 CCK8GraphPad Prism 的使用指南 #### CCK8 加入量的选择 在实验设计中,CCK8 试剂的加入量是一个重要的参数。说明书通常建议将其加入至培养基总体积的 10%,这意味着如果目标体系体积为 200 微升,则应将 CCK8 添加为 20 微升[^1]。然而,在实际操作中存在两种不同的理解方式:一种认为总体系包括细胞悬液、药物溶液以及 CCK8;另一种则排除 CCK8 自身所占的比例。尽管文献对此尚无统一结论,但从技术角度出发,推荐按照后者执行,即将细胞悬液与药物混合后的初始体积设定为目标值(如 200 微升),随后再按比例补充 CCK8。 #### 数据分析中的常见问题 当利用 GraphPad PrismCCK8 实验数据进行处理时,需注意几个关键环节: - **IC50 计算**:通过非线性回归拟合剂量反应曲线来获取 IC50 值是一项基础功能[^4]。在此过程中可能遇到数值转换带来的负数现象,这可通过适当调整坐标轴范围加以解决。 - **时间序列对比**:对于不同时间段内的细胞活力变化情况比较,可以借助重复测量 ANOVA 方法完成统计学检验[^2]。 #### 图像编辑技巧 除了数据分析外,科研成果展示同样重要。运用 Photoshop 进行图片优化能够显著提升文章质量。具体而言,涉及以下几个方面的工作流程[^3]: - 应用图层管理工具分离背景干扰; - 利用蒙版遮蔽不需要的部分; - 调整亮度对比度使细节更加清晰可见; - 如果必要的话还可以给黑白电子显微镜照片增添颜色以便更好地区分结构特征。 ```python import numpy as np from scipy.optimize import curve_fit def sigmoid(x, bottom, top, ec50, hill_slope): """定义sigmoid函数用于拟合""" return bottom + (top-bottom)/(1+np.exp((ec50-x)*hill_slope)) # 示例数据集 concentrations = [0.1, 0.2, 0.5, 1, 2, 5, 10] responses = [90, 75, 50, 30, 15, 5, 2] popt, pcov = curve_fit(sigmoid, concentrations, responses) print(f'EC50={popt[2]}') ``` 上述代码片段展示了如何基于 Python 中 SciPy 库实现简单的 S 形曲线拟合并提取 EC50 参数的过程。 ---
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