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这个作者很懒,什么都没留下…
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R生成图片svg tiff等
转自好友http://blog.sina.com.cn/s/blog_4be5711f01013e4z.htmlR作为统计语言环境,自然是做统计分析不在话下,但是R同时提供了强大的绘图功能,从低级绘图到高级绘图都有。但是图片默认绘制在X11设备上,面对精美的图片,我们常常想保留下来,用于展示或发表。欲如此,我们可用R提供的其他绘图设备,将好图存起。可有两种行为:一是打开设备并设置相关参数,转载 2012-08-29 13:27:25 · 11742 阅读 · 0 评论 -
DESeq分析基因的差异表达以及安装中出现的问题
DESeq采用NB(负二项分布检验的方式)对reads数进行差异显著性检验,同时还增加了矫正由于长度引起的误差,估算基因表达量的方式采用basemean值来估算表达量(标准化以后)这里,我在R下安装DESeq包出现了一些问题帮助总结一下。首先,我的R是15.0版本打开R source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite(原创 2012-09-14 11:09:50 · 18928 阅读 · 1 评论