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原创 MRI学习笔记-表征相似性分析(Representational Similarity Analysis, RSA)
表征相似性分析(RSA)是多体素模式分析(MVPA)的一种特定形式。是一种对刺激进行配对比较来揭示它们在高维空间表征的计算方法。除了分析不同类别刺激在神经信号中的表征差异之外,还可构建行为与神经数据的相关性。由于RSA的目标是测试观察到的(神经)表征是否与理想的或理论的表征相匹配,因此基本上可以用数据测试任何合理的假设,甚至可以用探索性的方式来帮助理解数据是如何构造的。RSA的基础是构建表征不相似性矩阵(representational dissimilarity matrix,RDM)。
2025-05-22 21:32:44
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原创 MRI学习笔记-gPPI
该脚本可以设置任务态的4D.nii图像,结构像.nii图像,condition,ROI。文件夹中,使用SPM的batch读取所有的.mat文件后运行,即可进行3D转4D。注:超过9个session时,前9个session的4D图像命名需要写为。选项三,平行处理,将所有的数据分为几个包运行,根据自己的电脑选择。选项一,在这台电脑运行,被试1结束开始被试2。生成的4D文件在原始图像文件的路径下(运行后生成的.mat文件会保存到。选项二,保存为脚本,稍后进行。duraion和name。生成的.csv格式保存在。
2025-04-28 15:47:59
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原创 MRI学习笔记-conjunction analysis
Expression中填写计算公式,两种条件是(i1>0)+(i2>0)*2,三种条件是(i1>0) + (i2>0)*2 + (i3>0)*4。Output Filename中填写输出图像的文件名,会保存到当前路径中。Input Images中加入要计算共激活的图像(这里是三个)spm中打开ImCalc。点击运行,即输出结果。
2025-04-27 12:06:51
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原创 MATLAB学习笔记目录
顺利毕业:MATLAB学习笔记-switch用法顺利毕业:MATLAB学习笔记-find函数的用法顺利毕业:MATLAB学习笔记-各种格式之间的转换顺利毕业:MATLAB学习笔记-矩阵排序,sort顺利毕业:MATLAB学习笔记-随机打乱矩阵,按行或列,randperm顺利毕业:MATLAB学习笔记-重复数组内容,repmat顺利毕业:MATLAB学习笔记-矩阵拼接顺利毕业:MATLAB学习笔记-字符串拼接(直接拼接,strcat函数)顺利毕业:MATLAB学习笔记-拼接、读取cell顺利毕业:MATLAB
2025-01-14 18:21:34
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原创 MATLAB学习笔记-table
里多了一层花括号,是因为我们要给“cell列”中的某一个元胞赋值,而元胞的内容本身可以是表、数值、字符串、元胞等任意类型。生成一个3行5列的table,命名为data2,行命名为rowNames,列命名为varNames,这样就可以在一开始就得到一个“所有位置都能任意放东西(因为都是元胞)”的table了。中的每个单元格都是“空元胞”(即。),你可以随时往其中塞任意内容。
2025-01-14 18:16:40
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原创 EMG预处理
假设你有一段实验数据(如肌电图),在某个事件发生时(例如“go”信号),你想要分析在该事件前后,肌肉活动的变化。你首先计算事件前后各个时刻的数据的均方根值,然后将这些值与事件前的基线期进行比较,得到相对于基线的变化,从而分析出肌肉活动的增减趋势。函数设计滤波器时,输入数据的格式可以是行向量或列向量。3.去除工频干扰,使用带阻滤波:48-52Hz。1.LP-filter低通:250 Hz。2.HP-filter高通:20Hz。cue前-300 ms到试次结束。
2024-12-21 14:02:17
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原创 R学习笔记-单因素重复测量方差分析
R语言之重复测量方差分析——ezANOVA的使用与解析 - 知乎单因素重复测量方差分析(One-Way Repeated Measures ANOVA)——R软件实现 - 梦特医数通
2024-10-29 22:45:27
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原创 MRI学习笔记-LItool使用教程,计算偏侧化指数lateralization index
描述功能偏侧化最常用的方法之一是计算偏侧化指数,分别是左侧和右侧感兴趣区域(ROI)中值高于特定激活阈值的体素数。因此,LI值的范围从+1(左主导)到1(右主导)。然而,这种方法的一个主要限制是LI对任意选择的激活阈值的强烈依赖。为了排除不同mask大小的影响,并允许使用非对称自定义mask,计算了一个mask加权因子(mwf),表示左边和右边mask体积的关系。
2024-10-14 15:32:51
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原创 基于windows下docker安装HDDM并运行
第二步:打开Hyper-V并安装Docker Desktop,看教程2 3 4部分。但是设置为WSL 2没有成功,但是检查后版本本来就是2,可以提前先检查一下版本。1.下载完docker安装包,安装提示不适合本电脑。这个界面,点击Upload,选择要分析的文件上传。下载WSL,看教程 方法二(时间有点久)。docker启动镜像HDDM。第一步:开启CPU虚拟化。复制链接在浏览器中打开。2.没有检测到WSL。
2024-09-18 21:36:12
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原创 在python中安装HDDM
whl安装包下载到C:\Users\lly\test\Scripts中,下面这个链接需要花钱。whl安装包下载到C:\Users\lly\test\Scripts中,下面这个链接需要花钱。numpy的whl安装包链接下载到C:\Users\lly\test\Scripts中。whl安装包下载到C:\Users\lly\test\Scripts中。注意每个安装包的版本,默认路径为C:\Users\lly。安装到C:\Users\lly\test文件下。激活C:\Users\lly\test路径。
2024-09-18 19:27:53
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原创 MATLAB学习笔记-cellfun和 isempty
要判断 cell 数组的前十行是否全为空(即都是空数组 []),您可以使用。函数来检查每个元素是否为空。
2024-05-02 18:06:21
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原创 MATLAB学习笔记-将变量a的值转换为两位数格式的字符串b
等),可以使用 MATLAB 中的字符串格式化功能来实现。,以确保输出的字符串始终是两位数(如。的值转换为指定格式的字符串。
2024-04-25 22:23:27
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原创 SSRT分布的贝叶斯参数估计方法
使用停止信号任务(stop signal task)研究反应抑制时需要计算停止信号反应时(stop signal reaction time,SSRT),发现Matzke等人(2013)开发了一种贝叶斯参数方法(Bayesian parametric approach,BPA),可以估计SSRTs的整个分布。BPA假设SSRT是前高斯分布,并使用马尔可夫链蒙特卡罗抽样(Markov chain Monte Carlo sampling)来估计SSRT分布的参数。
2024-04-02 20:00:16
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原创 MATLAB学习笔记-已知hit = 1,a = ‘hit‘,b = a,如何使b调用的是hit的值1
函数执行字符串中的 MATLAB 表达式。在这种情况下,你可以构造一个字符串,其中包含对变量。,可以使用 MATLAB 的。执行这个字符串,从而使变量。的值,而不是引用字符串。
2024-02-17 23:05:54
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原创 MATLAB学习笔记-读取与保存为excel
如何将matlab中的变量数据导出至excel中_matlab导出数据到excel-CSDN博客页面重载开启
2024-01-02 17:36:43
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原创 MRI学习笔记-合并多个session的fMRI数据
实验共有12个session,在某些session中有些condition不存在,在一阶分析和二阶分析时会报错,因此在预处理后将12个session的数据合并为1个进行后续一阶分析和二阶分析。
2023-12-05 14:28:46
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原创 MATLAB学习笔记-switch
执行多组语句中的一组 - MATLAB switch case otherwise- MathWorks 中国
2023-10-26 14:14:04
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空空如也
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