拷贝或者迁移openmpi

本文介绍如何将已安装的OpenMPI工具从一台机器迁移到另一台机器而无需重新安装,通过设置OPAL_PREFIX环境变量来解决二进制程序中硬编码的安装路径问题,并提醒设置LD_LIBRARY_PATH及注意额外组件的迁移。

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很多时候你会想要把一台机器上已经安装的openmpi 工具拷到其他机器上直接用,而不必在每一台机器上都重新安装一次。如果保证目标机器的openmpi文件夹路径与安装源的一致,那么没有问题。如果想换一个文件夹,即使是在同一台机器上迁移,openmpi是跑不起来的,原因是二进制程序里hard code了安装时的prefix 路径。


好在很早(1.2.1 版本以后)官方对这个就给了一个解决方案,设置 OPAL_PREFIX 环境变量,最简单的方法把新的位置加到 bashrc 文件里:

export OPAL_PREFIX=/openmpi-new-dir

更精细的,可以设置每个子目录的新位置,具体参考官方FAQ:re-locate openmpi


其他要说明的:

1. 记得设置 LD_LIBRARY_PATH

2. MPI 安装时可能选择了一些额外的组件,比如我这里用到了torque,那么 libtorque.so 也要拷贝过来,并且设置LD_LIBRARY_PATH



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