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原创 0 Linux 云服务器R studio server搭建 conda安装
在服务器安装好R和R studio sever后在浏览器输入ip:8787。使用R studio安装R包时报错,根据提示在服务器终端安装如下的依赖包。R studio server需要普通用户登陆,需要在服务器上新建用户。如果页面一直进不去,可能是端口问题。需要在云平台开放8787端口。R studio可正常运行。
2024-08-22 18:24:02 122
原创 2. R语言整理TCGA数据整理
的所有者和所属组都修改为 liutao,只有 liutao 用户可以访问该文件。本例使用Linux gdc-client下载TCGA数据。而R studio server 只能使用普通账户。在每个样本的文件夹中都保留一个“logs”文件夹。因此在上述代码中增加了grepl函数进行过滤。由于数据下载到服务器时使用的是root账户。修改ALL文件夹下所有文件的所有者。将metadata文件导入工作目录。使用R studio整理数据。
2024-08-22 17:46:13 241
空空如也
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