Pymol绘制点突变笔记

Pymol-蛋白位点突变_哔哩哔哩_bilibili

🔥干货｜蛋白互作＋做图｜详细操作步骤

1. 按照参考文件2，使用uniprot蛋白编码在https://alphafold.ebi.ac.uk/下载pdb文件

2. 使用pymol打开pdb文件

3. 点击右下角SEQ按钮，选择需要突变的位点

4. 对选中的位点使用sticks展示

5. 修改颜色

6. 点突变

7. 右下角选择需要突变的氨基酸

8. 点击需要突变的氨基酸

strain代表空间位阻，选择最小的

9. 导出图片：先保存突变，clear突变后保存野生型

10. 野生型：标记氨基酸与其它氨基酸的相互作用

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10.最终成果图

补充：如何使用代码选中大量的氨基酸

select my_selection,  resi 1-34

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本篇笔记供个人使用，请谨慎参考