python 社区发现算法

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熟知社区发现算法,你不能错过这个 Python 库。它涵盖 Louvain 算法、Girvan-Newman 算法等多种社区发现算法,还具有可视化功能。

网络是由一些紧密相连的节点组成的,并且根据不同节点之间连接的紧密程度,网络也可视为由不同簇组成。簇内的节点之间有着更为紧密的连接,不同簇之间的连接则相对稀疏。这种簇被称为网络中的社区结构(community structure)。

由此衍生出来的社区发现(community detection)算法用来发现网络中的社区结构,这类算法包括 Louvain 算法、Girvan-Newman 算法以及 Bron-Kerbosch 算法等。

最近,在 GitHub 上发现了一个可以发现图中社区结构的 Python 库 communities,该库由软件工程师 Jonathan Shobrook 创建。

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这个Python库超级棒啊,包含Louvain 算法、Girvan-Newman 算法等多种社区发现算法,还具有可视化功能
https://blog.51cto.com/u_11215354/5759629

项目地址:https://github.com/shobrook/communities

首先,该库可以实现以下几种社区发现算法:

Louvain 算法
Girvan-Newman 算法
层次聚类
谱聚类
Bron-Kerbosch 算法
其次,用户还可以使用 communities 库来可视化上述几种算法,下图为空手道俱乐部(Zachary’s karate club)网络中 Louvain 算法的可视化结果:

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该库的安装方法也非常简单,可采用 pip 的方式安装 communities,代码如下:

pip install communities

import numpy as np
from communities.algorithms import louvain_method

adj_matrix = np.array([[0, 1, 1, 0, 0, 0],
                       [1, 0, 1, 0, 0, 0],
                       [1, 1, 0, 1, 0, 0],
                       [0, 0, 1, 0, 1, 1],
                       [0, 0, 0, 1, 0, 1],
                       [0, 0, 0, 1, 1, 0]])
communities, _ = louvain_method(adj_matrix)

communities
[{0, 1, 2}, {3, 4, 5}]

 对于这个 Python 库,很多网友给予了高度评价,表示会去尝试。

算法详解

Louvain 算法

louvain_method(adj_matrix : numpy.ndarray, n : int = None) -> list

该算法来源于文章《Fast unfolding of communities in large networks》,简称为 Louvian。

作为一种基于模块度(Modularity)的社区发现算法,Louvain 算法在效率和效果上都表现比较好,并且能够发现层次性的社区结构,其优化的目标是最大化整个图属性结构(社区网络)的模块度。

Louvain 算法对最大化图模块性的社区进行贪婪搜索。如果一个图具有高密度的群体内边缘和低密度的群体间边缘,则称之为模图。

示例代码如下:

 

Girvan-Newman 算法

 

 

 

 

 

 

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### 回答1: 重叠社区发现算法是一种用于社交网络分析的算法,可以揭示社交网络中存在的不同重叠社区结构。在Python中,可以使用NetworkX库来实现重叠社区发现算法。 首先,需要导入NetworkX库,并创建一个有向图或无向图来表示社交网络。然后,可以使用NetworkX中的相关函数来执行重叠社区发现算法。 一种常见的重叠社区发现算法是基于节点的重叠社区结构的Louvain算法。以下是一个示例代码: ``` import networkx as nx import community # 创建一个无向图表示社交网络 G = nx.Graph() # 添加节点和边 G.add_nodes_from([1, 2, 3, 4, 5]) G.add_edges_from([(1, 2), (2, 3), (3, 4), (4, 5), (1, 5)]) # 使用Louvain算法进行重叠社区发现 communities = community.greedy_modularity_communities(G) # 打印每个节点所属的重叠社区 for i, com in enumerate(communities): print("Community", i+1, ":", com) ``` 上述代码首先导入了NetworkX库,并创建了一个无向图G。然后使用Louvain算法中的greedy_modularity_communities函数找到每个节点所属的重叠社区,最后打印出每个节点所属的重叠社区。 此外,还有其他重叠社区发现算法可供选择,例如在论文《Overlapping Community Detection in Social Networks: The State-of-the-Art and Comparative Study》中介绍的一种方法称为COPRA算法。 希望以上内容对于重叠社区发现算法Python中的实现有所帮助。 ### 回答2: 重叠社区发现算法是一种用于识别社交网络中重叠社区的方法。它能够发现网络中存在的多个社区,并且允许一个节点同时属于不同的社区。 在Python中,我们可以使用NetworkX库来实现重叠社区发现算法。NetworkX是一个用于创建、操作和研究复杂网络的Python库,具有强大的功能和易用的接口。 首先,我们需要引入NetworkX库并创建一个图对象。可以使用NetworkX提供的各种方法来加载网络数据,例如从文件中读取或手动添加节点和边。 接下来,我们可以使用现有的重叠社区发现算法来识别图中的重叠社区。NetworkX库提供了一些常见的重叠社区发现算法实现,例如Louvain算法、BigClam算法等。我们可以根据具体需求选择适合的算法。 调用重叠社区发现算法函数后,我们将获得一个包含重叠社区信息的结果对象。这个结果对象可以让我们查看每个节点属于哪些社区,并且可以对结果进行进一步的分析和可视化。 最后,我们可以根据实际需求决定如何使用重叠社区发现算法的结果。例如,我们可以根据节点在不同社区的重叠程度进行节点影响力分析,或者通过比较不同社区的结构特征来进行社区比较和聚类分析。 在这个简要的解答中,我向您介绍了使用Python中NetworkX库来实现重叠社区发现算法的基本步骤。具体的实施细节和算法选择取决于实际应用的需求和网络数据的特点。 ### 回答3: 重叠社区发现算法是一种用于识别复杂网络中存在的社区结构的方法。该算法可以帮助我们理解网络的内部连接方式和节点之间的关系,从而更好地研究网络的演化规律和功能。 在Python中,可以使用第三方库NetworkX来实现重叠社区发现算法。首先,我们需要导入NetworkX库,并创建一个有向或无向的图对象: ```python import networkx as nx # 创建一个无向图对象 G = nx.Graph() ``` 然后,我们可以通过添加节点和边来构建网络结构: ```python # 添加节点 G.add_node(1) G.add_node(2) # 添加边 G.add_edge(1, 2) ``` 接下来,我们可以使用第三方库`community`的`louvain`函数来进行重叠社区发现: ```python import community # 使用Louvain算法进行重叠社区发现 partition = community.best_partition(G) # 输出每个节点所属的社区编号 for node, comm_id in partition.items(): print(f"Node {node}: Community {comm_id}") ``` 最后,我们可以根据节点的社区归属,将节点分组为不同的社区: ```python # 创建一个空的字典,用于存储每个社区的节点 communities = {} # 将节点按照所属社区归类 for node, comm_id in partition.items(): if comm_id not in communities: communities[comm_id] = [node] else: communities[comm_id].append(node) # 输出每个社区的节点 for comm_id, nodes in communities.items(): print(f"Community {comm_id}: {nodes}") ``` 通过以上代码,我们就可以实现重叠社区发现算法的功能,并将节点归类到不同的社区中。 这是一个简单的用Python实现重叠社区发现算法的示例,实际使用时,还可以根据不同的问题和需求选择其他适合的算法和库来实现。

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