基于anaconda制作自定义环境的基础镜像-以obspy地震库为例
1.anaconda3下载安装:
下载地址:
进入官网下载Linux版本:
这里不用纠结下载哪个版本,下载最新的版本就可以,比如现在最新自带的基础环境是Python39,而我们需要用Python38,可以自己设置一个自定义的环境。
安装
一路回车或者输入yes就行,有一步可以自定义安装路径;
设置环境变量
将bin目录condabin目录添加到环境变量PATH中
2.自定义环境安装——以obspy为例
# 创建 obspy 运⾏环境
$ conda create -n obspy python=3.8
# 查看所有环境名称
$ conda info -e
# 激活 obspy 环境,这里如果第一次激活失败,可以执行 "source activate obspy"
$ conda activate obspy
# 安装 obspy 预编译包
(obspy) $ conda install obspy -c conda-forge
(obspy) $ conda update obspy
# 查看 obspy 版本
(obspy) $ python -c "import obspy; print(obspy.__version__)"
1.2.2
# 安装地图绘制包
(obspy) $ conda install cartopy
# 测试 obspy
$ obspy-plot -h # Simple script to plot waveforms in one or more files.
$ obspy-mopad -h # Just like MoPad.
可以到anaconda3目录下的env目录下多了一个obspy目录,这个目录就是我们自定的环境。
3.制作基础镜像
3.1 拉取anaconda3已有的镜像
docker pull continuumio/anaconda3
3.2 将其改名为一个容器
docker run --name anaconda3_base -idt continuumio/anaconda3
3.3 进入容器查看一下conda的安装位置
docker exec -it anaconda3_base /bin/bash
exit 退出
3.4 编写dockerfile
在我们本地安装的obspy目录同级新建一个Dockerfirle文件:
文件内容为:
FROM anaconda3_base
##设置控制台字符集编码
ENV LANG C.UTF-8
###设置docker容器的时间
ENV TZ=Asia/Shanghai
RUN ln -snf /usr/share/zoneinfo/$TZ /etc/localtime && echo $TZ > /etc/timezone
#拷贝目录,这里是将我们本地的envs目录下的obspy文件夹拷贝到容器中对应位置
ADD ./obspy /opt/conda/envs/obspy
#设置环境变量(这里很重要要不然新的容器无法自动激活obspy环境)
RUN echo "source activate" >> /root/.bashrc && echo "conda activate obspy" >> /root/.bashrc
ENV PATH /opt/conda/envs/obspy/bin:$PATH
3.5 构建镜像:
docker build -t python38_obspy_baseimage:1.0 .
进入镜像:
docker run -v /root/root --entrypoint /bin/bash -it python38_obspy_baseimage:1.0
可以看到直接进来就是obspy环境了,直接导包调用就可以了!
3.6 将镜像保存为tar包
docker save -o OBS_PYTHON38_BASE_Image.tar python38_obspy_baseimage:1.0
3.7 镜像加载
将tar包放到服务器的镜像仓库,通过以下命令加载:
docker load -i OBS_PYTHON38_BASE_Image.tar
加载成功,可以直接作为基础镜像使用。
参考文献:
https://blog.csdn.net/tomatt77/article/details/110155010
https://blog.csdn.net/qq_32101863/article/details/120344080
https://segmentfault.com/a/1190000039969652?sort=newest
https://blog.csdn.net/chenbaixing/article/details/106626599
https://blog.csdn.net/qq_37320062/article/details/111665207
https://blog.csdn.net/thedarkclouds/article/details/81990093
https://blog.csdn.net/qq_52813185/article/details/124949706
https://blog.csdn.net/weixin_27014595/article/details/112573556