R-应用流行病学和公共卫生-6.导出

rio包

使用rio，您可以export(). 首先给出要保存的 R 对象的名称（例如 linelist），然后在引号中输入要保存文件的文件路径，包括所需的文件名和文件扩展名。例如：

这会将数据框linelist作为 Excel 工作簿保存到工作目录/R 项目根文件夹：

export(linelist, "my_linelist.xlsx") # will save to working directory
export(linelist, here("data", "clean", "my_linelist.csv"))

到剪贴板

要将数据框导出到计算机的“剪贴板”（然后粘贴到 Excel、Google 电子表格等其他软件），您可以使用write_clip()--clipr包。

# export the linelist data frame to your system's clipboard
clipr::write_clip(linelist)

RDS 文件

除了 .csv、.xlsx 等，您还可以将 R 数据帧导出/保存为 .rds 文件。这是一种特定于 R 的文件格式，如果您知道您将在 R 中再次使用导出的数据，这将非常有用。

例如，如果您在流行病学团队工作并且需要将文件发送给 GIS 团队进行绘图，并且他们也使用 R，那么只需将 .rds 文件发送给他们！然后保留所有列类，它们要做的工作更少。

export(linelist, here("data", "clean", "my_linelist.rds"))

Rdata 文件和列表

.Rdata文件可以存储多个 R 对象 - 例如多个数据框、模型结果、列表等。这对于合并或共享给定项目的大量数据非常有用。

在下面的示例中，多个 R 对象存储在导出的文件“my_objects.Rdata”中：

rio::export(my_list, my_dataframe, my_vector, "my_objects.Rdata")

保存图

有关如何保存绘图的说明，例如由 创建的绘图，在ggplot 基础页面ggplot()中进行了深入讨论。

简单地，ggsave("my_plot_filepath_and_name.png")

资源

R 数据导入/导出手册
R 4 数据科学章节关于数据导入ggsave
() 文档

下面是一张表格，取自rio在线小插图。对于它显示的每种类型的数据：预期的文件扩展名，rio用于导入或导出数据的包，以及此功能是否包含在rio的默认安装版本中。

Format	Typical Extension	Import Package	Export Package	Installed by Default
Comma-separated data	.csv	data.table fread()	data.table	Yes
Pipe-separated data	.psv	data.table fread()	data.table	Yes
Tab-separated data	.tsv	data.table fread()	data.table	Yes
SAS	.sas7bdat	haven	haven	Yes
SPSS	.sav	haven	haven	Yes
Stata	.dta	haven	haven	Yes
SAS	XPORT	.xpt	haven	haven
SPSS Portable	.por	haven		Yes
Excel	.xls	readxl		Yes
Excel	.xlsx	readxl	openxlsx	Yes
R syntax	.R	base	base	Yes
Saved R objects	.RData, .rda	base	base	Yes
Serialized R objects	.rds	base	base	Yes
Epiinfo	.rec	foreign		Yes
Minitab	.mtp	foreign		Yes
Systat	.syd	foreign		Yes
“XBASE”	database files	.dbf	foreign	foreign
Weka Attribute-Relation File Format	.arff	foreign	foreign	Yes
Data Interchange Format	.dif	utils		Yes
Fortran data	no recognized extension	utils		Yes
Fixed-width format data	.fwf	utils	utils	Yes
gzip comma-separated data	.csv.gz	utils	utils	Yes
CSVY (CSV + YAML metadata header)	.csvy	csvy	csvy	No
EViews	.wf1	hexView		No
Feather R/Python interchange format	.feather	feather	feather	No
Fast Storage	.fst	fst	fst	No
JSON	.json	jsonlite	jsonlite	No
Matlab	.mat	rmatio	rmatio	No
OpenDocument Spreadsheet	.ods	readODS	readODS	No
HTML Tables	.html	xml2	xml2	No
Shallow XML documents	.xml	xml2	xml2	No
YAML	.yml	yaml	yaml	No
Clipboard default is tsv		clipr	clipr	No