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生物信息学
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【生信笔记】python实现DNA反向互补序列的6种方法
目录反向序列函数互补序列方法1:用字典dictionary互补序列方法2:python3 translate()方法互补序列方法3:最原始方法,用多个if分支互补序列方法4:对字符串调用replace()互补序列方法5: ASCII码作为列表下标测试用例反向序列函数def DNA_reverse(sequence): return sequence[::-1] # 求反向序列互补...原创 2019-11-29 18:21:55 · 14848 阅读 · 2 评论 -
【生信笔记】Emsenbl的BioMart工具:对RNA进行多种ID批量转换
大家好我是lotusng,本期blog我跟大家分享一个RNA的ID转换方法:利用Emsenbl的BioMart工具。众所周知(?),Emsenbl网站提供了多种物种的多种DNA与RNA的序列等信息,其实Emsenbl还有一个功能很强大的RNA 在线ID转换工具BioMart,我来安利一下~Emsenbl的BioMart工具: http://asia.ensembl.org/biomart/ma...原创 2019-03-11 19:10:46 · 12547 阅读 · 2 评论 -
【生信笔记】R version 3.5及以上安装Bioconductor心得
今天(2019-09-30)重装了最新版本的R和RStudio,版本号分别是R version 3.6.1 ,RStudio-1.2.5001。本来打算按教程 【R包选择镜像以及本地安装:https://blog.csdn.net/qq_29300341/article/details/53229215】来安装biocLite.R脚本,但是按旧方法装不上了。报错信息:报错信息中提...原创 2019-09-30 22:34:57 · 18017 阅读 · 3 评论